Sarbecovirus
Sarbecovirus
Wiriony z
SARS-CoV , a Sarbecovirus , widziana przez
skanowanie mikroskopem elektronowym .
Podgatunek
Sarbecovirus ICTV
Klasyfikacja filogenetyczna
Pozycja:
-
Gatunek : SARSr-CoV
-
-
-
SARSr-CoV HKU3 (nietoperz)
-
SARSr-CoV Rp3 (nietoperz)
-
-
-
-
SARS-CoV -1 (człowiek; SARS )
-
-
Sarbecovirus jest podgrupą z betacoronavirus zawierających koronawirusy związane z SARS , w tym SARS-CoV -1 i SARS-CoV-2 .
Nazwa Sarbecovirus to akronim, który łączy ze sobą pierwsze sylaby koronawirusa beta podobnego do SARS . Wirusy z podrodzaju Sarbecovirus były wcześniej znane jako koronawirusy grupy 2b.
Organizacja genomowa
Oprócz uzgadniania na podstawie homologii sekwencji nukleotydów , w obrębie rodzaju Betacoronavirus wirusy z podrodzaju Sarbecovirus charakteryzują się obecnością kilku otwartych ramek odczytu umiejscowionych między genami M i N.
Podrodzaj Sarbecovirus charakteryzuje się obecnością pojedynczej proteinazy podobnej do papainy (PL pro ) w otwartej ramce odczytu ORF1, zamiast dwóch w podrodzaju Embecovirus i rodzaju Alphacoronavirus .
Powiązane artykuły
Koronawirus powiązany z ciężkim ostrym zespołem oddechowym
Uwagi i odniesienia
-
(w) „ Taksonomia wirusów: wydanie 2018b ” , ICTV ,
lipiec 2018(dostęp 26 stycznia 2020 ) .
-
(en) Susanna KP Lau, Patrick CY Woo, Kenneth SM Li, Yi Huang, Hoi-Wah Tsoi, Beatrice HL Wong, Samson SY Wong Suet Yi Leung, Kwok-Hung Chan i Kwok-Yung Yuen , „ Ciężki ostry zespół oddechowy wirus podobny do koronawirusa u chińskich podkowców ” , Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , vol. 102 n O 39,
27 września 2005, s. 14040-14045 ( PMID 16169905 , PMCID 1236580 , DOI 10.1073 / pnas.0506735102 , JSTOR 3376824 , Bibcode 2005PNAS..10214040L , czytaj online )
-
(w) Conrad L. Schoch, Stacy Ciufo Mikhail Domrachev Carol L. Hotton, Sivakumar Kannan Rogneda Khovanskaya Detlef Leipe Richard Mcveigh Kathleen O'Neill, Barbara Robbertse, Shobha Sharma, Vladimir Soussov John P. -Mizrachi , „ Taksonomia NCBI: kompleksowa aktualizacja na temat kuracji, zasobów i narzędzi ” , Baza danych , t. 2020,
6 sierpnia 2020Poz n o baaa062 ( PMID 32761142 , PMCID 7408187 , DOI 10.1093 / database / baaa062 , czytać online )
-
(en) Maciej F. Boni, Philippe Lemey, Xiaowei Jiang, Tommy Tsan-Yuk Lam, Blair W. Perry, Todd A. Castoe, Andrew Rambaut i David L. Robertson , „ Evolutionary origin of the SARS-CoV -2 linia sarbecovirus odpowiedzialna za pandemię COVID-19 ” , Nature Microbiology , vol. 5, n O 11
listopad 2020, s. 1408-1417 ( PMID 32724171 , DOI 10.1038 / s41564-020-0771-4 , czytaj online )
-
10 lat temu wirus podobny do SARS-CoV-2 krążył już w Kambodży , Futura Santé
-
(w) „ Filogenezy betakoronawirusów podobnych do SARS, w tym nowego koronawirusa z Wuhan przy użyciu danych wygenerowanych przez Centrum Kliniczne Zdrowia Publicznego w Szanghaju i Szkołę Zdrowia Publicznego, Narodowy Instytut Kontroli i Zapobiegania Chorobom Wirusowym, Instytut Biologii Patogenów oraz Wuhan Institute of Virology udostępniony za pośrednictwem GISAID ” , na https://nextstrain.org/ ,
16 stycznia 2020 r(dostęp 25 stycznia 2020 ) .
-
(w :) Antonio CP Wong, Xin Li, Susanna Lau i KP Patrick CY Woo , „ Global Epidemiology of Coronaviruses Bat ” , Viruses , theft. 11 N O 2
luty 2019Artykuł n o 174 ( PMID 30791586 , PMCID 6409556 , DOI 10,3390 / v11020174 , czytać online )
-
(en) Patrick CY Woo , Ming Wang , Susanna KP Lau i Huifang Xu , „ Analiza porównawcza dwunastu genomów trzech nowych koronawirusów grupy 2c i grupy 2d ujawnia unikalne cechy grup i podgrup ” , Journal of Virology , tom . 81, n o 4,15 lutego 2007, s. 1574-1585 ( ISSN 0022-538X i 1098-5514 , PMID 17121802 , PMCID PMC1797546 , DOI 10.1128 / JVI.02182-06 , czytaj online , dostęp 31 marca 2021 )