Embecovirus to podgatunek z koronawirusa płci Betacoronavirus . Wirusy z tego podrodzaju, w przeciwieństwie do innych koronawirusów, mają gen esterazy hemaglutyniny (HE). Wirusy z podrodzaju były wcześniej znane jako koronawirusy grupy 2a.
Wirusy z tej podgrupy, podobnie jak inne koronawirusy, mają dwuwarstwową otoczkę lipidową, w której zakotwiczone są białka strukturalne błony (M), otoczki (E) i kolca (S). W przeciwieństwie do innych koronawirusów, wirusy z tego podrodzaju mają również dodatkowe, krótsze białko strukturalne w kształcie piku, zwane esterazą hemaglutyniny (HE).
Rekombinacja genetyczna może wystąpić, gdy dwa genomy wirusowe lub więcej są obecne w tej samej komórce gospodarza. Koronawirus beta (Beta-CoV HKU23) wykazuje różnorodność genetyczną w populacji wielbłądów. W przeszłości rzeczywiście wystąpiło kilka zdarzeń rekombinacji między blisko spokrewnionymi beta-CoV z podrodzaju Embecovirus, przyczyniając się do tej różnorodności.
„U wszystkich członków podgrupy A betakoronawirusów gen esterazy hemaglutyniny (HE), który koduje glikoproteinę o aktywności O-acetyloesterazy neuraminianu i aktywnym miejscu FGDS, jest obecny poniżej ORF1ab i powyżej genu S (Rysunek 1). "
„Patrz rysunek 2.”
„CoVs są podzielone na cztery rodzaje: Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus i Deltacoronavirus. W obrębie wirusa betakoronawirusa można je dalej podzielić na linie A, B, C i D [1]. W 2018 roku te cztery linie zostały przeklasyfikowane jako podgrupa Betacoronavirus i przemianowane na Embecovirus (poprzednia linia A), Sarbecovirus (poprzednia linia B), Merbecovirus (poprzednia linia C) i Nobecovirus (poprzednia linia D) [2]. Ponadto uwzględniono również piąty podrodzaj, Hibecovirus (ryc. 1) [2]. "
„Obecność genów HE wyłącznie u członków podgrupy betakoronawirusów A, ale nie u członków podgrupy betakoronawirusów B, C i D sugeruje, że rekombinacja prawdopodobnie wystąpiła u przodka członków podgrupy Betakoronawirusa A, po odejściu od przodka innych podgrup wirusa betakoronawirusa. "