Enterococcus

Enterococcus

Enterococcus Opis tego obrazu, również skomentowany poniżej Enterococcus w tkance płucnej Klasyfikacja
Królować Bakteria
Podział Firmicutes
Klasa Bacilli
Zamówienie Lactobacillales
Rodzina Enterococcaceae

Uprzejmy

Enterococcus
(ex Thiercelin & Jouhaud 1903 )
Schleifer & Kilpper-Bälz 1984

Na enterokoki są aero-beztlenowe kadłuby metabolizm, powiedzmy ziarniaki do Gram-dodatnie, zwykle w postaci łańcuchów. Są patogenami oportunistycznymi powodującymi posocznicę, infekcje dróg moczowych lub infekcje brzucha pochodzenia jelitowego. Są przyczyną ponad 10% zakażeń szpitalnych .

Przez bardzo długi czas enterokoki były klasyfikowane w obrębie rodzaju Streptococcus , aż do roku 1984, kiedy analiza genomu wykazała, że ​​bardziej odpowiednie było utworzenie rodzaju Enterococcus. To połączenie wynika w szczególności z faktu, że enterokoki posiadają antygen ściany D, wspólny dla bakterii z rodzaju Streptococcus ( Streptococcus gallolyticus , Streptococcus infantarius itp.). Rodzaj Enterococcus i podrodzaj Streptococcus D można odróżnić na podstawie zasolenia pożywki hodowlanej. Rzeczywiście, Enterococcus można hodować na pożywce hipersalinowej (6,5% Nacl).

Dwa główne gatunki to Enterococcus faecalis i Enterococcus faecium .

Są dość odporne na kwasy, co pozwala im przejść przez barierę żołądkową .

W wodzie pitnej , są wskaźniki typu kałowego zanieczyszczenia , takie jak E. coli .

Niektóre szczepy są odporne na antybiotyki . Ich oporność na niektóre antybiotyki i profil zjadliwości różnią się w zależności od wyizolowanych szczepów. Pacjenci mogą być również mniej lub bardziej podatni na to.

Siedlisko

Jak sugeruje ich nazwa (jelitowe + muszla), są częścią flory komensalnej i występują w szczególności w przewodzie pokarmowym i moczowo-płciowym (w tym w cewce moczowej).

Ekologia

Ekologii enterokoków różni się od paciorkowców i adaptacji do środowiska jelitowego, w którym są one zwykle komensale mniejszościowe daje im szereg właściwości różne od paciorkowców. W szczególności są bardziej odporne na zewnątrz. Podobnie jak w przypadku E. coli , ich obecność w wodzie pitnej lub pożywieniu wskazuje na zanieczyszczenie odchodami .

Pojawieniu się szczepów opornych na antybiotyki prawdopodobnie sprzyjało stosowanie antybiotyków u ludzi, ale także w weterynarii, rolnictwie i przemyśle spożywczym ( wankomycyna i inne glikopeptydy ). Na przykład stosowanie awoparcyny (glikopeptydu szeroko stosowanego w Europie, ale nie w Stanach Zjednoczonych czy Kanadzie) przez ponad 20 lat jako czynnika wzrostu w suplementacji diety zwierząt hodowlanych umożliwiło wyselekcjonowanie enterokoków typu VANA opornych na obie wankomycyna i awoparcyna. Twierdzenie to potwierdza izolacja enterokoków VANA z odchodów świń i kurczaków z niemieckich i duńskich gospodarstw przy użyciu awoparcyny, podczas gdy enterokoki izolowane z gospodarstw niestosujących antybiotyków w suplementacji zwierząt są wrażliwe na glikopeptydy.

Diagnostyka bakteriologiczna

Enterococci to Gram-dodatnie ziarniaki charakteryzujące się pewnym polimorfizmem: muszle często nierównej wielkości, w diplokokokach lub krótkich łańcuchach. Są nieruchome i bez kapsuły.

Nie są wybrednymi bakteriami i mogą rosnąć na zwykłych płytkach agarowych. Ich kultura jest łatwiejsza i bardziej obfita niż u paciorkowców. Wykazują zmętnienie w bulionie i lekko opalizujące kolonie o wielkości plus minus 1,5  mm na agarze. Na agarze z krwią kolonie mogą być niehemolityczne lub α-hemolityczne. Na pożywce zawierającej żółć i eskulinę enterokoki rozwijają się przez hydrolizę eskuliny (czarne halo).

Enterococci należą do grupy D klasyfikacji Lancefielda (Ag D jest wspólna dla wielu taksonów) i mają pozytywny wynik PYR. Dla wszystkich bakterii z grupy D Lancefielda charakter hemolityczny traci na znaczeniu z punktu widzenia patogeniczności. Szczególnie w przypadku infekcji dróg moczowych, ropni brzusznych lub posiewów krwi obecność bakterii „ viridans ” powinna sugerować obecność enterokoków.

Pożywką najczęściej używaną do wykrywania enterokoków jest pożywka zawierająca żółć i eskulinę .

Enterococci (ale także pałeczki kwasu mlekowego i listeria , które na szczęście nie są małżami) rosną poprzez zmianę koloru podłoża na czarny: czernienie podłoża odzwierciedla hydrolizę eskuliny w eskuletynie, która wiąże się z żelazem III.

Głównymi bohaterami odróżniającymi je od paciorkowców są:

Identyfikacja biochemiczna może wykorzystywać galerię API 20 Strepto ( Biomérieux ). Pierwsza część testuje enzymy i produkcję butan-diolu, druga część wykorzystania różnych węglowodanów .


Gatunki identyfikuje się za pomocą multipleksowej reakcji PCR . Fenotypy oporności na glikopeptydy i poszukiwanie głównych genów wirulencji izolowanych szczepów.

Patogeneza

Dwa gatunki najczęściej spotykane w patologii człowieka to: Enterococcus faecalis i Enterococcus faecium, które mogą być źródłem infekcji u wrażliwych pacjentów. To oportunistyczne bakterie chorobotwórcze.

Najczęstsze warunki to:

Epidemiologia

Infekcje bakteryjne ( bakteriemia ) wywołane przez enterokoki są uważane za prawie zawsze infekcje pochodzenia endogennego, co wymaga dostosowanych strategii kontrolowania ryzyka szpitalnego. W szpitalach bakterie te mogą być odpowiedzialne za poważne zakażenia szpitalne, z których pierwszą wykryto we Francji w połowie lat 80.

Na przykład badanie prospektywne przeprowadzone w Szpitalu Uniwersyteckim w Nîmes w latach 2004-2005 skupiło się na 33 pacjentach o medianie wieku 68 lat (3-96). Wykryto 33 szczepy enterokoków, szpitalne w 60,6% przypadków.
Zakażenia były następstwem interwencji chirurgicznej w 54,5% przypadków, a rokowanie życiowe w 63,6% przypadków (7 z tych pacjentów zmarło w trakcie hospitalizacji, tj. 21,2%, ale nie wywołano epidemii). Główne wejście wydawało się trawienne, ze znaczną liczbą infekcji związanych z cewnikiem .
Czynnikami współistniejącymi były układ krążenia i układ pokarmowy.
Zakażenia były na ogół monomikrobiologiczne (75,8%), z powodu Enterococus faecalis w 87,9% przypadków.
U tych pacjentów izolaty E. faecalis były zabijane przez amoksycylinę i glikopeptydy, ale antybiotyki były oporne na norfloksacynę , erytromycynę i pristynoamycynę . Tak samo dla Enterococus faecium (także w przypadku znacznej oporności na amoksycylinę).
W przeciwieństwie do E. faecium, E. faecalis posiadało maksymalnie genów wirulencji .

Diagnoza biologiczna

Diagnozę stawia się poprzez hodowlę różnego rodzaju próbek:

Leczenie

Terapia antybiotykowa

Jedną z trudności w leczeniu jest oporność enterokoków na wiele antybiotyków.

We Francji enterokoki oporne na wankomycynę nadal wydają się rzadkie.

Fagoterapia

Terapia fag jest stosowany u ludzi w niektórych krajach, takich jak Rosja i Gruzja. W Rosji można znaleźć koktajl bakteriofagowy specjalnie zaprojektowany przeciwko paciorkowcom w aptekach i innych bardziej ogólnych koktajlach, które zawierają bakteriofagi przeciw paciorkowcom.

We Francji terapia fagowa jest możliwa tylko na podstawie tymczasowego zezwolenia na stosowanie wydanego przez ANSM . W obliczu braku rozwiązania w postaci tradycyjnego obwodu opieki we Francji utworzono organizacje pacjentów, aby ułatwić dostęp do zagranicznych bakteriofagów.

Jakość wody

Wiele krajów uchwaliło drastyczne przepisy dotyczące wody z kranu, wody butelkowanej oraz wody w kąpieliskach. Na przykład stan Hawaje w Stanach Zjednoczonych narzuca mniej niż 7 bakterii tworzących kolonie na 100 ml wody, powyżej których stan może opublikować ostrzeżenia wzywające społeczeństwo do trzymania się z dala od wody. ”Ocean.
W 2004 roku Enterococcus spp. zajął miejsce grupy bakterii coli w kale dla nowego federalnego standardu jakości wody w kąpieliskach na plażach publicznych, ponieważ ten wskaźnik jest uważany za reprezentatywny dla wielu innych patogenów kałowych, a zwłaszcza w ściekach (kanalizacji, które mogą przeciekać lub przelewać się, zwłaszcza na obszarach osiadań górniczych i po trzęsieniach ziemi W niektórych krajach głównym czynnikiem zanieczyszczenia są ścieki odprowadzane do środowiska naturalnego bez oczyszczania przez oczyszczalnię ścieków .

Zapobieganie, środki ostrożności

Lista gatunków

Według NHSP

W kwietniu 2021 odnotowano następujące gatunki:

Niektóre gatunki liczone wcześniej w Enterococci zostały przeklasyfikowane do innych rodzajów:

Uwagi i odniesienia

  1. https://lpsn.dsmz.de/genus/enterococcus , dostęp 12.04.21.
  2. P r . A. Bouvet (krajowe centrum referencyjne ds. Paciorkowców, Hôtel-Dieu, Uniwersytet Paris VI ); Ogólny kurs bakteriologii (online) ; „Streptococci-enterococci” dostęp 8 czerwca 2010
  3. E. Pilly, wydanie z 2010 r .: praca referencyjna na temat patologii zakaźnej i tropikalnej w języku francuskim
  4. (en) Furuno JP, Harris AD, Wright MO. et al. „Zasady przewidywania dotyczące identyfikacji pacjentów z opornymi na metycylinę Staphylococcus aureus i enterokokami opornymi na wankomycynę po przyjęciu do szpitala” American Journal of Infection Control . 2004; 32 (8): 436-40.
  5. (w) Leclercq R Derlot E, Weber M, Duval J. & P. ​​Courvalin "Transferable vancomycin and teicoplanin Resistance in Enterococcus faecium  " Antimicrob Agents Chemother . 1989; 33 (1): 10-5. PMID 2523687
  6. (en) Calfee DP Giannetta AND Durbin LJ. et al. „Kontrola endemicznych enterokoków opornych na wankomycynę wśród pacjentów hospitalizowanych w szpitalu uniwersyteckim” Clinical Infectious Diseases 2003; 37 (3): 326-32. PMID 12884155
  7. J.-P. Lavigne, H. Marchandin, E. Czarnecki, C. Kaye, A. Sotto; Enterococcus spp. : badanie perspektywiczne w Szpitalu Uniwersyteckim w Nîmes; Biologia patologii; Tom 53, numer 8-9; strony 539-545 (październik-listopad 2005); Doi: 10.1016 / j.patbio.2005.06.005 ( streszczenie )
  8. Oporność enterokoków na glikopeptydy: pierwsza epidemia szpitalna we Francji?  ; List chorób zakaźnych; 1995; 19-20: 708-709.
  9. Eliopoulos GM. Środki przeciwbakteryjne do leczenia poważnych infekcji wywołanych przez oporne gronkowce złociste i enterokoki . European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases 2005; 24 (12): 826–831.
  10. (w) PK Linden , „  Opcje leczenia zakażeń opornych na wankomycynę i enterokoki  ” , Drugs , Vol.  62, n o  3,2002, s.  425-441 ( ISSN  0012-6667 i 1179-1950 , czytaj online )
  11. Netgen , „  Infections Enterococci: from simple to bardziej skomplikowane ... - Review Medical Switzerland  ” w Review Medical Switzerland (dostęp: 9 lutego 2017 )
  12. (ru) "  Бактериофаг стрептококкковый  " , na bacteriofag.ru (dostęp 14 kwietnia, 2018 )
  13. (ru) "  Пиобактериофаг поливалентный очищенный  " , na bakteriofag.ru (dostęp 12 kwietnia 2018 )
  14. "  Phages-Sans-Frontières - Razem możemy spróbować zmienić los!"  » , Na phages-sans-frontieres.com (dostęp 14 kwietnia 2018 )
  15. "  Association PHAG ESPOIRS  " , on Association PHAG ESPOIRS (dostęp: 14 kwietnia 2018 )
  16. "  EuroPhages - Ratowanie życia tysięcy Francuzów dzięki bakteriofagom  " , na EuroPhages (dostęp 14 kwietnia 2018 )
  17. Hawajski Departament Zdrowia; Oddział Czystej Wody  ; konsultowano 2007-02-08
  18. Jin G, Jeng HW, Bradford H, Englande AJ; Porównanie E. coli, enterokoków i bakterii z grupy coli w kale jako wskaźników oceny jakości wody słonawej  ; Journal = Water Environ. Res. ; tom = 76; numer = 3; strony = 245–55; Rok: 2004; doi = 10,2175 / 106143004X141807
  19. Huang SS, Rifas-Shiman Sl, Pottinger JM, et al. Poprawa oceny enterokoków opornych na wankomycynę poprzez rutynowe badania przesiewowe . Journal of Infectious Diseases 2007; 195 (3): 339–346.
  20. Singh N, Leger MM, Campbell J i wsp. Kontrola enterokoków opornych na wankomycynę na oddziale intensywnej terapii noworodków . Kontrola zakażeń i epidemiologia szpitalna 2005; 26 (7): 646–649.
  21. Duckro AN, Blom DW, Lyle EA i wsp. ; Przenoszenie enterokoków opornych na wankomycynę rękami pracownika służby zdrowia . Archives of Internal Medicine 2005; 165 (3): 302-307.
  22. Duckro AN, Blom DW, Lyle EA i wsp. Transfer opornych na wankomycynę; enterokoki przez ręce pracownika służby zdrowia. Archiwa wewnętrzne; Medicine 2005; 165 (3): 302-307.
  23. Gordin FM, Schultz ME, Huber RA i wsp. Zmniejszenie zakażenia szpitalnego bakterii lekoopornych po wprowadzeniu preparatu do odkażania rąk na bazie alkoholu . Kontrola zakażeń i epidemiologia szpitalna 2005; 26 (7): 650–653.
  24. Lankford MG, Collins S, Youngberg L i wsp. Ocena materiałów powszechnie stosowanych w opiece zdrowotnej: implikacje dla przeżycia i przenoszenia bakterii . American Journal of Infection Control 2006; 34 (5): 258-263.
  25. D'Agata EM, Web G, Horn M. Model matematyczny określający ilościowo wpływ ekspozycji na antybiotyki i inne interwencje na endemiczne występowanie enterokoków opornych na wankomycynę . Journal of Infectious Diseases 2005; 192 (11): 2004-2011.

Zobacz też

Powiązane artykuły

Linki zewnętrzne

Bibliografia

w zakładach opieki zdrowotnej - Operacyjna karta techniczna. Ministerstwo Zdrowia i Solidarności. 4 strony. (Nr 18205)

Komitet Techniczny ds. Zakażeń Szpitalnych i Zakażeń Opieki Zdrowotnej. Przyjęto w dniu 6.10.2005 r. 5 stron.

liczba zgłoszeń szpitalnych zakażeń enterokokami opornych na wankomycynę. Ministerstwo Zdrowia i Solidarności. 2 strony.

2005. 21 stron.