Mikroflory w ludzkim organizmie , uprzednio zwane mikroorganizmów flory z ludzkiego organizmu , to wszystkie bakterie , mikro- grzyby i inne mikroorganizmy , że ciało ludzkie zawierają w dużej ilości. Najbardziej zbadaną ludzką mikroflorą jest mikrobiom jelitowy . Mikrobiota jelitowa jest niezwykle zróżnicowana (różnorodność biologiczna taksonomiczna , genetyczna i funkcjonalna). Różni się w zależności od osoby i zmienia się w czasie, szczególnie w miesiącach następujących po urodzeniu i podczas okresów choroby.
Większość organizmów mikrobioty występuje naturalnie na skórze lub w przewodzie pokarmowym, gdzie wykonują użyteczne zadania, nawet niezbędne dla przeżycia pojedynczego żywiciela. W normalnych warunkach nie powodują chorób (nazywane są również „normalną florą”). Tworzą „złożoną społeczność ekologiczną”, która „wpływa na normalną fizjologię i podatność na choroby poprzez zbiorową aktywność metaboliczną i jej interakcje z żywicielem” . Ta społeczność jest czasami uważana za społeczność symbiontów .
Najbardziej znanym z organizmów mikrobioty jest bakteria Escherichia coli , która żyje w okrężnicy .
Jeśli układ odpornościowy jest osłabiony, większość tych bakterii w normalnej florze działa jak patogeny oportunistyczne.
Mikrobiota ludzka jest bardzo zróżnicowana;
W tej samej populacji każdy osobnik jest nosicielem innej mikrobioty (inny skład i różne proporcje, na przykład Bacteroidetes , Fusobacteria lub Firmicutes, a niektóre rodziny, w szczególności Ruminococcaceae i Lachnospiraceae, są szczególnie bogate w filotypy ).
Wreszcie, w każdym większym regionie świata mikroorganizmy również się różnią.
Mikrobiota każdego człowieka bardzo się zmienia od urodzenia (mikrobiota łożyska) do końca okresu dojrzewania, aby ustabilizować się w wieku dorosłym.
Szacuje się, że w organizmie człowieka żyje od 15 do 30 000 różnych gatunków bakterii, a liczba ta stale rośnie wraz z postępem badań i wciąż jest przedmiotem dyskusji. Zawiera również mniejszą ilość archeonów , które w szczególności odgrywają ważną rolę w rozwoju miażdżycy poprzez regulację tlenku trimetyloaminy .
Chociaż normalna flora znajduje się na wszystkich powierzchniach wystawionych na działanie środowiska (skóra, oczy, nos, jelito cienkie i okrężnica ), zdecydowana większość bakterii znajduje się głównie w jelicie grubym. W artykule opublikowanym w American Journal of Clinical Nutrition z 1972 roku oszacowano, że liczba komórek drobnoustrojów (średnio dziesięciokrotnie mniejsza niż komórek ludzkich) jest dziesięciokrotnie większa niż liczba komórek ludzkich, czyli sto bilionów mikroorganizmów (10 14 ). Liczby te od dawna dominują w środowisku naukowym. Biorąc pod uwagę dużą liczbę ostatnich danych eksperymentalnych, izraelscy naukowcy szacują, że całkowita liczba bakterii zamieszkałych przez „człowieka odniesienia” (człowieka w wieku od 20 do 30 lat, ważącego 70 kg i mierzącego 1,70 m ) wynosi 3,9,10 13 , z marginesem błędu 25%, czyli około 1 bakteria na 1 komórkę organizmu.
Wiele bakterii w układzie pokarmowym (część mikroflory jelitowej ) jest w stanie rozkładać węglowodany (cukry), których ludzie nie byliby w stanie strawić w innym przypadku. Większość z tych komensalnych bakterie są beztlenowe, to znaczy, mogą przetrwać w środowisku tlenu pozbawiony.
Escherichia coli to bakteria żyjąca w okrężnicy . Jest to dobrze zbadany organizm modelowy i prawdopodobnie najbardziej znany z bakterii. Niektóre zmutowane szczepy tej bakterii we florze jelitowej powodują choroby, na przykład szczep E. coli O157: H7.
Niektóre bakterie, takie jak Actinomyces Viscosus i A. naeslundi , żyją w jamie ustnej, gdzie tworzą na zębach biofilm, który tworzy płytkę nazębną . Jeśli płytka ta nie jest czyszczona przez regularne szczotkowanie, twardnieje tworząc kamień nazębny, który może ułatwiać próchnicę . Staramy się lepiej poznać mikrobiotę jamy ustnej , w szczególności w celu ułatwienia montażu protez zębowych zakotwiczonych w kości szczęki . Problemy ze stawami lub kościami były wcześniej związane z brakiem równowagi lub zmianami w mikrobiocie jamy ustnej.
Mikroflora pochwy lub „mikroflora pochwy ” jest zwykle bardzo stabilna i składa się zasadniczo z 4 rodzajów bakterii typu pałeczki kwasu mlekowego . Jednak zakłócenie flory pochwy może prowadzić do bakteryjnego lub grzybiczego zapalenia pochwy i wielu stanów chorobowych.
Większość drobnoustrojów jelitowych jest nieszkodliwa lub korzystna dla gospodarza.
Mikrobiota jelitowa chroni przed enteropatogenami, w szczególności poprzez wytwarzanie octanu w jelicie, wydobywa składniki odżywcze i energię z bolusa pokarmowego oraz przyczynia się do prawidłowego funkcjonowania układu odpornościowego . Obejmuje oprócz bakterii , archeonów , grzybów , pierwotniaków i wirusów , rola tych ostatnich nie została jeszcze wyjaśniona.
Bakterie są niezbędne do utrzymania zdrowia ludzkiego, ale kilka lub inne w pewnych okolicznościach (np. Niedobór odporności ) również stanowią poważne zagrożenie dla zdrowia, wywołując choroby lub wydają się być zaangażowane w problemy, takie jak otyłość .
Na skórze oraz w przewodzie pokarmowym i sferze laryngologicznej żyje wiele bakterii.
Na skórze wzrost niektórych z nich może być zwiększony przez ciepło i pot .
Wraz z grzybami częściowo odpowiadają za zapach ciała (pocenie się, zapach skóry, włosów, oddechu itp.), A niektóre odgrywają rolę w trądziku ( Propionibacterium acnes ).
Istnieje ponad 500 gatunków bakterii obecnych w ludzkich jelitach i ich funkcje są na ogół korzystne: syntetyzują one witaminy, takie jak kwasu foliowego do witaminy K i biotyną , a także węglowodany . Inne korzystne bakterie w normalnej florze obejmują bakterie z grupy Lactobacillus , które przekształcają białka mleka w kwas mlekowy w jelitach. Obecność takich kolonii bakteryjnych zapobiega również rozwojowi bakterii potencjalnie patogennych (niektóre bakterie znane jako korzystne są również sprzedawane jako probiotyczne suplementy diety). Wszystkie z nich wytwarzają antygeny.
U dzieci narażonych na te antygeny wcześnie , większa różnorodność drobnoustrojów jelitowych zmniejsza przyszłe ryzyko alergii i egzemy (dotyczy to również niektórych chorób autoimmunologicznych i innych zaburzeń odporności, na przykład cukrzycy typu 1 ), co tłumaczy wzrost alergie w bogatych krajach, gdzie dzieci żyją w bardziej odkażonych środowiskach niż gdzie indziej, a jednocześnie są narażone na działanie dużej liczby chemikaliów pochodzenia antropogenicznego. Jelitowy układ odpornościowy małych dzieci zyskuje na wielokrotnym kontakcie z większą różnorodnością antygenów bakteryjnych. Niektóre bakterie mogą odgrywać ważniejszą rolę ( Bacteroidetes i Proteobacteria według ostatnich badań) lub nawet Bifidobacteria i Clostridia według starszych badań.
Chociaż zdecydowana większość bakterii jest nieszkodliwa lub pożyteczna, kilka bakterii chorobotwórczych wywołuje choroby zakaźne. Najczęstszą chorobą bakteryjną jest gruźlica , wywoływana przez bakterię Mycobacterium tuberculosis , która zabija około dwóch milionów ludzi rocznie, głównie w Afryce Subsaharyjskiej. Bakterie chorobotwórcze przyczyniają się do innych chorób o znaczeniu światowym, takich jak zapalenie płuc, wywoływanych przez bakterie, takie jak paciorkowce i Pseudomonas , oraz chorób przenoszonych przez żywność, które mogą być wywoływane przez bakterie, takie jak Shigella , Campylobacter i salmonella . Bakterie chorobotwórcze powodują również infekcje, takie jak tężec, dur brzuszny, błonica, kiła i trąd.
Każdy gatunek patogenu ma charakterystyczny zakres interakcji z żywicielami ludzkimi. Takie organizmy, takie jak gronkowce lub paciorkowce, mogą powodować infekcje skóry, zapalenie płuc, zapalenie opon mózgowych, a nawet śmiertelną sespsę, ogólnoustrojową reakcję zapalną powodującą wstrząs, masywne rozszerzenie naczyń i śmierć. Jednak te organizmy są również częścią normalnej ludzkiej flory i zwykle występują na skórze lub w nosie, nie powodując żadnych patologii.
Inne organizmy niezmiennie powodują choroby u ludzi, takie jak riketsja , które są obligatoryjnymi pasożytami wewnątrzkomórkowymi zdolnymi do wzrostu i rozmnażania się tylko w komórkach innych organizmów. Jeden gatunek riketsji powoduje tyfus, podczas gdy inny jest odpowiedzialny za gorączkę plamistą Gór Skalistych . Chlamydia , inny Phylum wewnątrzkomórkowych bezwzględnych pasożytów zawiera związki, które mogą spowodować zapalenie lub zakażenie dróg oddechowych, może być związane z chorobą niedokrwienną serca. Wreszcie, niektóre gatunki, takie jak Pseudomonas aeruginosa , Burkholderia cenocepacia i Mycobacterium avium, są patogenami oportunistycznymi i wywołują choroby głównie u osób cierpiących na immunosupresję lub mukowiscydozę.