Alpha wariant z SARS-CoV-2 , zwany także B.1.1.7 lub nawet VOC-202012/01 , lub Wariant Concern 202012/01 , poprzednio VUI-202012/01 , zwany także „ English wariant ” lub „ wariant brytyjski ”, to wariant SARS-CoV-2 , koronawirusa odpowiedzialnego za Covid-19 . Po raz pierwszy wykryto go wpaździernik 2020podczas pandemii Covid-19 w Wielkiej Brytanii z próbek pobranych w poprzednim miesiącu i szybko rozprzestrzenił się od połowygrudzień 2020. Jego rozprzestrzenianie się jest skorelowane ze znacznym wzrostem liczby przypadków Covid-19 w Wielkiej Brytanii. Uważa się, że wzrost ten jest przynajmniej w części ze względu na N501Y mutacji w S. peplomer wirusa wpływ na domenę wiążącą receptor lub RBD (dla domeny wiążącej receptor ), zdolne do wiązania się z l przekształcającego enzymu. angiotensyny 2 (ACE2) ą pozostałość z asparaginy jest zastąpiony przez tyrozynę w pozycji 501.
Te mutacje z SARS-CoV-2 są częste: ponad 4000 mutacje wykrytogrudzień 2020tylko w S- glikoproteinie . Analiza mutacji to powszechny sposób śledzenia rozprzestrzeniania się wirusów w populacji. Oprócz tego, że był na przykład w stanie wykazać, że SARS-CoV-2 rozprzestrzenił się w Wielkiej Brytanii z tysiąca punktów wejścia, wykazał również, że wariant niosący mutację G614 całkowicie zastąpił szczepy niosące D614 mutacja.
Wariant VOC-202012/01 charakteryzuje się 23 mutacjami:
lub 17 mutacji indukujących zmianę aminokwasów w białkach ulegających translacji z wirusowego RNA .
W lutym 2021 r. mutacja E484K, wpływająca na szczyt białka wirusa, upodabniając go do wariantów południowoafrykańskich i brazylijskich, rozprzestrzenia się głównie w południowo-zachodniej Anglii i niepokoi naukowców.
Brytyjscy naukowcy NERVTAG (w) wskazują18 grudnia 2020że najprawdopodobniej wariant VOC-202012/01 jest znacznie bardziej zaraźliwy niż inne. Jednak dane, którymi dysponują, są niewystarczające, aby wyjaśnić mechanizm leżący u podstaw tej zwiększonej przenoszenia, rozkład przypadków według wieku lub ciężkości przypadków. Szacują, biorąc pod uwagę podwojenie względnej częstości występowania tego wariantu co 6,4 dnia, że jest on dwa razy bardziej zaraźliwy niż oryginalny wirus, przy współczynniku selekcji wynoszącym 70%. Identyfikują również korelację między wyższym współczynnikiem reprodukcji a wykryciem wariantu B.1.1.7.5. Chociaż mogą istnieć inne wyjaśnienia, prawdopodobnie ta korelacja wynika z większej przepuszczalności tego wariantu; analizy laboratoryjne powinny wyjaśnić ten punkt.
Jedną z najważniejszych mutacji wariantu VOC-202012/01 jest N501Y. Ta mutacja wpływa na motyw wiążący receptor lub RBM (od motywu wiążącego receptor ), grupę reszt RBD , które wchodzą w bezpośredni kontakt z ludzkim ACE2 . Mutacje w tym poziomie modyfikowanie przeciwciała rozpoznawania i swoistość wiązania S peplomer do ACE2.
NERVTAG szacuje, że: 18 grudnia 2020że nie ma wystarczających danych, aby wnioskować co do ciężkości Covid-19 wywołanego przez wariant VOC-202012/01 SARS-CoV-2 . Władze brytyjskie wskazują następnego dnia, że nie było wówczas dowodów na to, że nowy wariant wirusa jest bardziej śmiertelny lub że inaczej reaguje na szczepionki lub leczenie.
Sekwencjonowanie wariantu VOC-202012/01 wykazała mutację Q27stop - zastąpienie reszt glutaminy w pozycji 27 przez kodon-stop - który obcina białka z ORF8 ( otwarta ramka odczytu N O 8) i czyni go nieaktywnym. We wcześniejszych badaniach, warianty SARS-CoV-2 brak genów otwartej ramki odczytu N O 8 były związane z łagodnych objawów i lepszą prognozą .
Delecja w pozycjach 69-70 z S- glikoproteiny Obserwowany „wirusy, które omijają odpowiedź immunologiczną u niektórych pacjentów z upośledzeniem odporności” i Stwierdzono również, „w połączeniu z innymi modyfikacjami RBD” .
Koniec 2020kilka szczepionek było w trakcie opracowywania lub było już w użyciu przeciwko Covid-19. Większość z nich celuje w glikoproteinę S jako główny antygen , a wariant VOC-202012/01 SARS-CoV-2 ma kilka mutacji tego białka. Jednak układ odpornościowy wytwarza przeciwciała skierowane kilka regionów tego białka w odpowiedzi na te szczepionki, więc jest za mało prawdopodobne, że mutacja w S. peplomer będzie wpływać na skuteczność tych szczepionek. Jednak kumulacja mutacji może spowodować konieczność modyfikacji szczepionek. SARS-CoV-2 mutuje na przykład wolniej niż wirusy grypy , dzięki czemu szczepionki, które okazały się skuteczne, kończą się2020 to te, które można w razie potrzeby dostosować.
Jednak w lutym 2021 r. naukowcy byli zaniepokojeni mutacją E484K wariantu brytyjskiego, znalezioną głównie w południowo-zachodniej Anglii, która może wpływać na skuteczność szczepionek.
Przypadek według kraju (aktualizacja 14 lipca 2021 r.) GISAID | ||
---|---|---|
Kraj | Potwierdzone przypadki | Ostatni zgłoszony przypadek |
Wielka Brytania | 266,195 | 27 czerwca 2021 |
Kanada | 226 246 | 6 lipca 2021 |
Stany Zjednoczone | 201.185 | 29 czerwca 2021 |
Niemcy | 101,697 | 28 czerwca 2021 |
Dania | 59 856 | 29 czerwca 2021 |
Szwecja | 56,325 | 21 czerwca 2021 |
Francja | 32 208 | 28 czerwca 2021 |
Holandia | 27 660 | 25 czerwca 2021 |
Japonia | 27 404 | 1 lipca 2021 |
Włochy | 24 075 | 30 czerwca 2021 |
szwajcarski | 21 690 | 26 czerwca 2021 |
Hiszpania | 19,360 | 05 lipca 2021 |
Belgia | 20 355 | 01 lipca 2021 |
Polska | 14 723 | 21 czerwca 2021 |
Irlandia | 14 875 | 23 czerwca 2021 |
Litwa | 9208 | 11 czerwca 2021 |
Izrael | 8019 | 24 czerwca 2021 |
Norwegia | 8056 | 23 czerwca 2021 |
Słowenia | 7 930 | 20 czerwca 2021 |
Finlandia | 5865 | 25 maja 2021 |
Grecja | 5.440 | 07 czerwca 2021 |
Portugalia | 4961 | 23 czerwca 2021 |
Słowacja | 4.206 | 19 czerwca 2021 |
Luksemburg | 3975 | 25 maja 2021 |
Chorwacja | 3,941 | 11 czerwca 2021 |
Austria | 3666 | 20 czerwca 2021 |
Republika Czeska | 3,831 | 24 czerwca 2021 |
Indie | 3812 | 01 czerwca 2021 |
Łotwa | 3145 | 28 maja 2021 |
Estonia | 2842 | 08 maja 2021 |
Bułgaria | 2889 | 17 maja 2021 |
Meksyk | 1476 | 24 czerwca 2021 |
Tajlandia | 736 | 20 czerwca 2021 |
Rumunia | 646 | 15 czerwca 2021 |
Filipiny | 1,027 | 30 marca 2021 |
indyk | 606 | 25 maja 2021 |
Korea Południowa | 589 | 08 czerwca 2021 |
Aruba | 549 | 16 czerwca 2021 |
Brazylia | 496 | 01 czerwca 2021 |
Australia | 500 | 04 lipca 2021 |
Kenia | 452 | 03 czerwca 2021 |
Kambodża | 348 | 26 czerwca 2021 |
Święty Marcin | 334 | 24 czerwca 2021 |
Rosja | 331 | 12 czerwca 2021 |
Curaçao | 311 | 19 maja 2021 |
Sri Lanka | 321 | 25 czerwca 2021 |
Ghana | 367 | 24 kwietnia 2021 |
Macedonia Północna | 249 | 22 kwietnia 2021 |
Katar | 257 | 23 maja 2021 |
Singapur | 189 | 17 czerwca 2021 |
Pakistan | 180 | 28 maja 2021 |
Bonaire | 174 | 15 czerwca 2021 |
Kazachstan | 174 | 27 kwietnia 2021 |
Nowa Zelandia | 150 | 14 czerwca 2021 |
Malta | 148 | 11 czerwca 2021 |
Chile | 155 | 12 czerwca 2021 |
Nigeria | 143 | 19 marca 2021 |
Afryka Południowa | 166 | 17 czerwca 2021 |
Gibraltar | 131 | 08 marca 2021 |
Argentyna | 126 | 07 maja 2021 |
Ekwador | 147 | 17 czerwca 2021 |
Chiny | 116 | 07 czerwca 2021 |
Wyspy Kanaryjskie | 110 | 10 marca 2021 |
Maroko | 101 | 22 kwietnia 2021 |
Kostaryka | 115 | 24 maja 2021 |
Bangladesz | 91 | 08 czerwca 2021 |
Kolumbia | 87 | 25 maja 2021 |
Jordania | 81 | 04 maja 2021 |
Bośnia i Hercegowina | 66 | 21 czerwca 2021 |
Irak | 70 | 09 marca 2021 |
Gwadelupa | 70 | 08 czerwca 2021 |
Spotkanie | 60 | 08 czerwca 2021 |
Angola | 58 | 23 kwietnia 2021 |
Gambia | 53 | 25 marca 2021 |
Indonezja | 56 | 28 czerwca 2021 |
Ukraina | 52 | 18 marca 2021 |
Iran | 52 | 08 maja 2021 |
Bahrajn | 51 | 14 czerwca 2021 |
Gujana Francuska | 44 | 22 maja 2021 |
Guam | 39 | 11 maja 2021 |
Gabon | 35 | 05 maja 2021 |
Gwinea Bissau | 33 | 05 lutego 2021 |
Tajwan | 32 | 29 maja 2021 |
Dżibuti | 62 | 31 marca 2021 |
Węgry | 29 | 26 lutego 2021 |
Albania | 27 | 11 marca 2021 |
Palestyna | 27 | 09 kwietnia 2021 |
Wietnam | 26 | 06 maja 2021 |
Gruzja | 23 | 06 kwietnia 2021 |
Serbia | 23 | 11 marca 2021 |
Kuwejt | 25 | 05 czerwca 2021 |
Martynika | 22 | 25 maja 2021 |
Iść | 21 | 25 lutego 2021 |
Zjednoczone Emiraty Arabskie | 21 | 29 grudnia 2020 r. |
Barbados | 20 | 21 maja 2021 |
Islandia | 20 | 05 stycznia 2021 |
ŚW | 20 | 29 kwietnia 2021 |
Senegal | 24 | 30 kwietnia 2021 |
Uganda | 17 | 15 czerwca 2021 |
Liban | 16 | 3 maja 2021 |
Wybrzeże Kości Słoniowej | 15 | 09 marca 2021 |
Jamajka | 15 | 12 lutego 2021 |
Surinam | 15 | 14 maja 2021 |
Armenia | 14 | 18 marca 2021 |
Kamerun | 14 | 17 kwietnia 2021 |
Egipt | 13 | 17 maja 2021 |
Gwinea | 12 | - |
Malezja | 11 | 04 czerwca 2021 |
Nepal | 11 | 02 czerwca 2021 |
Cypr | 10 | 27 stycznia 2021 |
Wallis i Futuna | 10 | 19 kwietnia 2021 |
Trynidad i Tobago | 9 | 04 maja 2021 |
Demokratyczna Republika Konga | 8 | 28 marca 2021 |
Republika Dominikany | 8 | 14 kwietnia 2021 |
Peru | 15 | 07 kwietnia 2021 |
Liechtenstein | 7 | 16 maja 2021 |
Czarnogóra | 7 | 21 stycznia 2021 |
Rwanda | 7 | 21 maja 2021 |
Antigua i Barbuda | 5 | 06 maja 2021 |
Kajmany | 5 | 15 maja 2021 |
Wyspy Turks i Caicos | 5 | 22 marca 2021 |
Dominika | 4 | 01 kwietnia 2021 |
Paragwaj | 4 | 08 kwietnia 2021 |
Portoryko | 4 | 11 czerwca 2021 |
Azerbejdżan | 3 | 07 lutego 2021 |
Białoruś | 3 | 24 lutego 2021 |
Burkina Faso | 3 | 03 lutego 2021 |
Etiopia | 3 | 04 lutego 2021 |
Kosowo | 3 | 06 stycznia 2021 |
Malta | 3 | 10 czerwca 2021 |
Moldova | 3 | 03 marca 2021 |
Monako | 3 | 17 kwietnia 2021 |
Republika Konga | 4 | 05 marca 2021 |
Tunezja | 7 | 08 marca 2021 |
Anguilla | 2 | 23 marca 2021 |
Bermudy | 2 | 05 stycznia 2021 |
Republika Środkowoafrykańska | 2 | - |
Wyspy Owcze | 2 | 04 maja 2021 |
Granat | 2 | 08 kwietnia 2021 |
Malawi | 2 | 08 marca 2021 |
Majotta | 2 | 21 maja 2021 |
Montserrat | 2 | 05 lutego 2021 |
Myanmar | 2 | 28 maja 2021 |
Somali | 6 | 05 marca 2021 |
Zambia | 2 | 11 lutego 2021 |
Belize | 1 | 20 stycznia 2021 |
Brytyjskie Wyspy Dziewicze | 1 | 19 kwietnia 2021 |
Gwinea Równikowa | 1 | 09 lutego 2021 |
Gwatemala | 1 | 07 kwietnia 2021 |
Haiti | 1 | 19 maja 2021 |
Honduras | 1 | 23 kwietnia 2021 |
Mauritius | 1 | 10 stycznia 2021 |
Mozambik | 1 | 21 kwietnia 2021 |
Mariany Północne | 1 | 29 kwietnia 2021 |
Oman | 30 | 22 grudnia 2020 r. |
Arabia Saudyjska | 1 | 15 kwietnia 2021 |
Niger | 1 | 9 stycznia 2021 |
Libia | 1 | 5 czerwca 2021 |
Południowy Sudan | 1 | 3 kwietnia 2021 |
Burundi | 1 | 27 maja 2021 |
Świat (160 krajów) | Razem: 1 208 985 | Razem na dzień 14 lipca 2021 r. |
Pierwszy przypadek dotyczył prawdopodobnie osoby zidentyfikowanej w połowiewrzesieńw hrabstwie Kent w Wielkiej Brytanii. Następnie zidentyfikowano ponad tysiąc przypadków w połowiegrudzień 2020w Wielkiej Brytanii, głównie w południowo-wschodniej Anglii . Inne przypadki zidentyfikowano w Walii i Szkocji . Około jedna czwarta przypadków Covid-19 w Londynie (w) była spowodowana rozpoczęciem nowego wariantulistopad, proporcja, która osiągnęła trzeci początek grudzień ; oszacowaliśmy w połowiegrudzieńże 60% przypadków Covid-19 w Londynie było spowodowanych tym nowym wariantem. Na20 grudniadziewięć przypadków VOC-202012/01 wykryto w Danii , cztery w Belgii i jeden w Holandii , Australii i we Włoszech . Niedługo potem wariant ten znaleziono również w Islandii i Gibraltarze , a następnie w Singapurze , Izraelu i Irlandii Północnej na23 grudnia, w Niemczech i Szwajcarii na24 grudnia, a w Irlandii , Japonii i Francji na25 grudnia. Koniecgrudzień 2020Wariant brytyjski rozprzestrzenił się w szczególności w Europie , Ameryce Północnej ( Kanada , Stany Zjednoczone ), Azji ( Korea Południowa ), Ameryce Południowej ( Chile ) i Azji Południowej ( Indie ).
Uważany za 50 do 70% bardziej zaraźliwy, wariant ten szybko zyskuje przewagę nad początkowym wirusem we Francji: stanowi 35% wirusów krążących we Francji lub Stanach Zjednoczonych w połowie marca 2021 r. i reprezentuje prawie wszystkie przypadki wykryte w wczesny maj.