Nukleaza mikrokokowa

Nukleaza jądrowa mikrokoków w temperaturze kriogenicznej ( PDB 3H6M ) Kluczowe dane

Nr WE	WE 3.1.31.1
numer CAS	9013-53-0

Aktywność enzymatyczna

IUBMB	Wpis IUBMB
IntEnz	Widok IntEnz
BRENDA	Wejście BRENDA
KEGG	Wejście KEGG
MetaCyc	Szlak metaboliczny
PRIAM	Profil
PDB	Struktury

Nukleazy micrococcal ( Numer EC 3.1.31.1 ) jest endo - egzonukleazy , która działa korzystnie na kwasach nukleinowych jednoniciowe wytwarzania mononukleotydów i oligonukleotydów 3 „fosforanu. Szybkość wycinania tego enzymu jest 30 razy większa, gdy działa on na końcu 5 ' adeniny lub tyminy w porównaniu z guaniną lub cytozyną . Enzym ten ma również aktywność przeciwko RNA i dwuniciowemu DNA , ostatecznie powodując rozszczepienie wszystkich sekwencji.

Synonimy

Inne nazwy tego enzymu to: nukleaza mikrokokowa, nukleaza S7, MNaza, endonukleaza śledziony, termonukleaza, nukleaza T, endonukleaza mikrokokowa, nukleaza T ', nukleaza gronkowcowa, fosfodiesteraza śledziony, nukleaza nukleotydowa Staphylococcus aureus, nukleaza aureusowa Staphylococcus aureus (deoksynukleaty)

Charakterystyka

Enzym ten ma masę cząsteczkową 16,9 KDa i jest ściśle zależny od Ca 2+ . Jego optymalne pH zmienia się wraz ze stężeniem Ca 2+ i dlatego jest łatwo inaktywowany przez środek kompleksujący EGTA.

Źródło

Enzym ten jest zewnątrzkomórkową nukleazą Staphylococcus aureus. Dwa szczepy, V8 i Foggi wytwarzają praktycznie identyczne formy tego enzymu. Powszechnym źródłem produkcji jest zrekombinowany szczep Escherichia coli, który posiada gen nukleazy gronkowcowej.

Struktura

Trójwymiarowa struktura nukleazy mikrokokowej (zwanej wówczas nukleasa staphyilococcale) została rozwiązana w 1969 roku, jako jedno z pierwszych osiągnięć w historii krystalografii rentgenowskiej białek, poprzez zdeponowanie jej w Protein Data Bank z kodem archiwalnym 1SNS (obecnie przestarzałe). Nowsze struktury o wysokiej rozdzielczości są dostępne dla postaci apolipoproteiny (kod PDB 1SNO) oraz formy hamowanej związanej z difosforanem tymidyny (kody PDB 3H6M 3H6M lub PDB 1SNO 1SNC )

Jak widać na powyższym diagramie wstążkowym, cząsteczka tej nukleazy ma 3 helisy alfa i beczkowaty arkusz beta utworzony przez pięć łańcuchów, układ zwany fałdowaniem OB (przez wiązanie oligonukleotydów , tj. Utrwalacz oligonukleotydów w języku angielskim ), zgodnie z klasyfikacją bazy danych Structural Classification of Proteins (SCOP).

Aplikacje

Hydroliza kwasów nukleinowych do surowych ekstraktów komórkowych.
Sekwencjonowanie z RNA (ze względu na degradację DNA)
Przygotowanie lizatów retikulocytów królika.
Badania struktury chromatyny .
Ablacja kwasów nukleinowych z preparatów białkowych w laboratorium, aby umożliwić badanie trójwymiarowych konformacji białek i zależności struktura-funkcja.
Badania mechanizmów fałdowania białek .

Uwagi i odniesienia

Heins JN, Suriano JR, Taniuchi H, Anfinsen CB (1967).
Cusumano CL, Taniuchi H, Anfinsen CB (1968).
Arnone A, Bier J, et al. (1971).

http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/micrococcal-nuclease/ (angielski)

http://www.worthington-biochem.com/nfcp/default.html (angielski)

http://www.thermoscientificbio.com/uploadedfiles/resources/en0181-usa-msds.pdf - Karta norm bezpieczeństwa produktu (w języku angielskim)

http://www.thermoscientificbio.com/uploadedfiles/resources/en018-product-information.pdf - Karta informacji o produkcie (w języku angielskim)

Linki zewnętrzne

(w) MeSH Micrococcal + Nuclease : Micrococcal + Nuclease (w języku angielskim)
Nomenklatura WE 3.1.31.1