Polipowatość gruczolakowata coli | ||
Superhélice N -terminal a CPA human ( PDB 1DEB ) | ||
Główne cechy | ||
---|---|---|
Zatwierdzona nazwa | Regulator ścieżki sygnalizacyjnej APC, WNT | |
Symbol | APC | |
Synonimy | Fosfataza białkowa 1, podjednostka regulacyjna 46 | |
Homo sapiens | ||
Umiejscowienie | 5 q 22,2 | |
Waga molekularna | 311 646 Da | |
Liczba pozostałości | 2843 aminokwasów | |
Wejdź | 324 | |
HUGO | 583 | |
OMIM | 611731 | |
UniProt | P25054 | |
RefSeq ( mRNA ) | NM_000038.5 , NM_001127510.2 | |
RefSeq ( białko ) | NP_000029.2 , NP_001120982.1 | |
Razem | ENSG00000134982 | |
PDB | 1DEB , 1EMU , 1JPP , 1M5I , 1T08 , 1TH1 , 1V18 , 2RQU , 3AU3 , 3NMW , 3NMX , 3NMZ , 3QHE , 3RL7 , 3RL8 , 3T7U , 4G69 , 4YJE , 4YJL , 4YK6 | |
GENATLAS • z GeneTests • z GoPubMed • KL • H InvDB • Treefam • Vega | ||
Linki dostępne z GeneCard i HUGO . |
Białku APC od angielskiej polipowatości gruczolakowatej coli jest cząsteczką, która reguluje stężenie beta-katenina , która działa z kadheryna E , który bierze udział w adhezji komórek . U ludzi jest kodowany przez gen APC znajdujący się na chromosomie 5 . Znamy ortologi wszystkich ssaków, dla których dostępne są obszerne dane genomiczne . Te mutacje w tym genie może prowadzić do raka jelita grubego .
APC jest genem supresorowym guza . Geny tego typu zapobiegają niekontrolowanej proliferacji komórek , która może przekształcić się w raka . Białka wynikających z ekspresji tego genu, odgrywa decydującą rolę w wielu procesach komórkowych, które mogą prowadzić do guza . Pozwala kontrolować częstotliwość mitozy , sposób, w jaki komórka przylega do swoich sąsiadów w tkance biologicznej , nabywanie przez komórkę jej polarności, morfogenezę struktur trójwymiarowych, a nawet ruch komórki w tkaninie lub na zewnątrz. Pomaga również upewnić się, że liczba chromosomów wytwarzanych w wyniku podziału komórki jest prawidłowa. Pełni te różne funkcje głównie poprzez łączenie się z innymi białkami, w szczególności tymi zaangażowanymi w adhezję i sygnalizację komórkową . W szczególności kontroluje aktywność β-kateniny poprzez białka Wnt . Regulacja β-kateniny zapobiega zbyt częstej aktywacji genów stymulujących podziały komórkowe, a także nadmiernemu wzrostowi komórek.
Najczęstsza mutacja w raku okrężnicy prowadzi do inaktywacji białka APC. W przypadku braku takich mutacji obserwuje się zamiast nich mutacje, które aktywują β-kateninę . Mutacje w białku APC mogą być wrodzone lub występować spontanicznie w komórkach somatycznych , często w wyniku mutacji w innych genach, które zmniejszają możliwości naprawy DNA . Aby rak się rozwinął, oba allele genu muszą zostać dotknięte. Po mutacjach APC lub β-kateniny muszą następować inne mutacje, aby stać się rakowymi; jednak u nosicieli mutacji inaktywujących APC ryzyko zachorowania na raka okrężnicy w wieku 40 lat wynosi prawie 100%.
Rodzina polipowatości jelita grubego wywodzi się z wrodzonych mutacji w genie białka APC inaktywującego. Większość z tych mutacji wytwarza nienormalnie krótkie, przypuszczalnie niefunkcjonalne białko APC. To skrócone białko nie zapobiega nadmiernemu rozwojowi tkanki prowadzącemu do tworzenia się polipów , które mogą przekształcić się w raka . Najczęstszą mutacją w rodzinnej polipowatości okrężnicy jest delecja pięciu zasad w genie APC . Powstałe białko sekwencja zmienia się od reszty 1309.
Inny rodzaj mutacji, który dotyka około 6% osób pochodzenia aszkenazyjskiego , polega na zastąpieniu reszty izoleucyny w pozycji 1307 resztą lizyny , oznaczonej I1307K. Początkowo sklasyfikowany jako niezauważalny, okazuje się, że zwiększyłoby to ryzyko zachorowania na raka okrężnicy.
Pełna ludzkie białka 2843 pozostałości z aminokwasami do A masie cząsteczkowej z 311,6 kDa . Trójwymiarową strukturę domeny N- końcowej kilku z tych białek wyjaśniono z dużą rozdzielczością. Większość białka wydaje się nieuporządkowana, ale nie wiadomo, czy ten duży region bez zauważalnej struktury obserwowanej in vitro , który zawiera reszty od 800 do 2843, pozostaje in vivo, czy jest tam stabilizowany przez nieznane białka, które mogłyby z nim oddziaływać. Wykazano również, że region, który koncentruje mutacje wokół środka białka, jest wewnętrznie zaburzony in vitro .