Proteaza treoninowa

Proteazy treoniny jest peptydazą którym reszta z aminokwasów nukleofilem w triadzie katalitycznej jest treoninę . W katalitycznych podjednostek o proteasomu są Prototyp tej rodziny enzymów , ale acylotransferaz zostały poddane ewolucyjny zbieżności w kierunku tego samego typu i geometrii mechanizmu reakcji ich miejsca aktywnego .

Proteazy treoninowe wykorzystują drugorzędowy alkohol ich N -końcowej treoniny jako resztę nukleofilową wymaganą do katalizy . Reszta ta musi być N -końcowa, ponieważ koniec amidowy działa jak zasada polaryzując cząsteczkę wody, która deprotonuje drugorzędowy alkohol i zwiększa jego reaktywność jako nukleofilu.

Kataliza zachodzi w dwóch etapach:

  1. z nukleofilowe pozostałości atakuje podłoże w celu utworzenia kowalencyjnego acylo-enzym półprodukt , który uwalnia pierwszego produktu;
  2. półprodukt jest hydrolizowany w celu uwolnienia drugiego produktu i regeneracji wolnego enzymu.

Ten typ mechanizmu reakcji jest wspólny dla enzymów, których miejsce aktywne wykorzystuje triadę katalityczną .

Uwagi i odniesienia

  1. (w) Masaki Unno, Tsunehiro Mizushima Yukio Morimoto, Yoshikazu Tomisugi, Keiji Tanaka, Noritake Yasuoka i Tomitake Tsukihara , „  The Structure of the Mammalian 20S Proteasome at 2,75 Å  ” , Structure , vol.  10 N O  5, Maj 2002, s.  609-618 ( PMID  12015144 , DOI  10.1016 / S0969-2126 (02) 00748-7 , czytaj online )
  2. (w) James A. Brannigan, Guy Dodson, Helen J. Duggleby Peter CE Moody, Janet L. Smith, Diana R. Tomchick i Alexey G. Murzin , „  Zrębowe białko katalityczne z N-końcowym nukleofilem jest zdolne do -aktywacja  ” , Nature , vol.  378 n O  6555, 23 listopada 1995, s.  416-419 ( PMID  7477383 , DOI  10.1038 / 378416a0 , czytaj online )
  3. (w) Hua Cheng i Nick V. Grishin , „  DOM-krotność: struktura z krzyżującymi się pętlami znaleziona w DMPA, acetylotransferazy ornityny i domenie wiążącej kofaktor molibdenu  ” , Protein Science , Vol.  14 N O  7, Lipiec 2005, s.  1902-1910 ( PMID  15937278 , DOI  10.1110 / ps.051364905 , czytaj online )
  4. (w) Guy Dodson i Alexander Wlodawer , „  Triady katalityczne i ich powiązania  ” , Trends in Biochemical Sciences , tom.  23 N O  9, Wrzesień 1998, s.  347-352 ( PMID  9787641 , DOI  10.1016 / S0968-0004 (98) 01254-7 , czytaj online )
  5. (w) Özlem Doğan Ekici, Mark Paetzel i Ross E. Dalbey , "  Niekonwencjonalne proteazy serynowe: Wariacje na temat konfiguracji katalitycznej triady Ser / His / Asp  " , Protein Science , tom.  17 N O  12, grudzień 2008, s.  2023-2037 ( PMID  18824507 , DOI  10.1110 / ps.035436.108 , czytaj online )