Klasyfikacja wirusów nie jest zintegrowany z działalności prowadzonej dla istot żywych , bardzo członkostwa z wirusami w żyjącego świata , będących przedmiotem dyskusji. Dwie metody są miarodajne:
Te dwie metody klasyfikacji nie są antagonistyczne i można je łatwo zintegrować ze sobą, ponieważ klasyfikacja ICTV wykorzystuje pewne kryteria klasyfikacji Baltimore. Żadne z dwóch zastrzeżeń nie jest filogenetyczne , ponieważ wspólnego pochodzenia wirusów nie można jeszcze wykazać przez porównanie ich sekwencji nukleotydowych. Krok w kierunku klasyfikacji filogenetycznej został jednak przekroczony w październiku 2018 r. Z uznaniem przez grupę ICTV jednoniciowego RNA wirusa o ujemnej polarności przez gałąź , dwie podgałęzie i sześć klas .
Różne formy wirusów wynikają z faktu, że jedna z dwóch nici DNA, w których wszystkie formy życia komórkowego zachowują informacje genetyczne, jest zbędna, a zatem wirusy mogą mieć genomy jedno- lub dwuniciowe. Ponadto genom niektórych wirusów składa się raczej z RNA niż DNA. RNA występuje w komórkach jako pośrednik, gdy geny ulegają translacji do białek . Genom wirusów RNA może być kodowany w dwóch różnych kierunkach: albo geny są przechowywane w kierunku 5 '→ 3' (biegunowość dodatnia lub +), tak jak ten, w którym geny są kodowane w informacyjnym RNA komórek, albo są przechowywane w przeciwnym kierunku (ujemna lub - biegunowość).
Taksonomii wirusów jest podobna do tej z organizmów komórkowych:
Zamówienie (przyrostek: -virales ) Rodzina (przyrostek: -viridae ) Podrodzina (przyrostek: -virinae ) Płeć (przyrostek: -virus ) GatunkiJednak kod nomenklatury zarządzany przez Międzynarodowy Komitet Taksonomii Wirusów (ICTV) różni się od innych w kilku aspektach. W większości nazwy rzędów i rodzin są zapisane kursywą, a nazwy gatunków nie są zgodne z nomenklaturą dwumianową, ale często mają postać [wirusa] [choroby] . Definicja zamówień jest bardzo nowa i celowo jest powolna; Do tej pory tylko trzy zostały nazwane, a większość rodzin nie została sklasyfikowana. W 2014 roku opisano 7 rzędów, 104 rodziny, 23 podrodziny, 505 rodzajów i 3186 gatunków wirusów.
W październiku 2018 roku ICTV wykonał krok w kierunku klasyfikacji filogenetycznej , zatwierdzając przyszłe użycie 15 rang taksonomicznych (domena, subdomena, królestwo, subdomena, typ), podtyp, klasa, podklasa, rząd, podrzędność, rodzina, podrzędność -rodzina, rodzaj, podrodzaj, gatunek) oraz poprzez walidację jednej gałęzi, dwóch podgałęzi i sześciu klas. Walidowaną gałęzią są jednoniciowe wirusy RNA o ujemnej polarności , zwane Negarnaviricota i podzielone na dwie podgałęzie: Haploviricotina (w tym wirus Ebola i wirus wścieklizny ) i Polyploviricotina (w tym wirus gorączki Lassa) oraz wirus grypy A ). ICTV aktualizuje również swoją listę taksonów niższego rzędu: 14 rzędów, 7 podrzędów, 143 rodziny, 64 podrodziny, 846 rodzajów, 59 podgatunków i 4,958 gatunków. Lista uznanych taksonów jest dostępna online.
Informacje genetyczne tych wirusów są przechowywane w postaci DNA.
Grupa I - Wirusy dwuniciowego DNAInformacje genetyczne są przechowywane w postaci RNA.
Grupa III - Wirusy dwuniciowe RNAOficjalizacja w październiku 2018 rangi taksonomicznej gałęzi dla jednoniciowych wirusów RNA o ujemnej polarności ( Negarnaviricota ) opiera się na filogenezie uniwersalnego markera wirusów RNA, polimerazy RNA zależnej od RNA . Podział tej gałęzi na dwie podgałęzie ( Haploviricotina i Polyploviricotina ) i sześć klas opiera się na tym samym markerze, ale także na pochodzeniu genów białek kapsydu . Przyjęta klasyfikacja jest następująca, aż do rangi rodzin (pełna klasyfikacja obejmuje rodzaje i gatunki):
Informacja genetyczna jest kodowana w postaci RNA. Enzym związany z wirusem, odwrotna transkryptaza , tworzy DNA z RNA, aby zapewnić replikację w komórce gospodarza.
Informacje genetyczne są kodowane w postaci DNA. Replikacja oparta jest na mRNA.
Zobacz Capside