Nir Friedman

Nir Friedman Biografia
Narodziny 1967
Trening Uniwersytet Stanforda w Tel Awiwie
Zajęcia Bioinformatyk , informatyk
Inne informacje
Pracował dla Uniwersytet Hebrajski w Jerozolimie
Pole Uczenie maszynowe i biologia obliczeniowa
Kierownik Joseph Y. Halpern
Wybitny uczeń Dana Pe'er  (en)
Stronie internetowej www.cs.huji.ac.il/~nir
Nagrody Nagroda EW Beth Thesis (1998)
Stypendysta ISCB (2014)

Nir Friedman (ur 1967) jest profesorem z informatyki i biologii na Uniwersytecie Hebrajskim w Jerozolimie .

Jego badania koncentrują się na połączeniu uczenia maszynowego i uczenia statystycznego z biologią systemów , szczególnie w obszarach regulacji ekspresji genów , transkrypcji i chromatyny .

Szkolenia i badania

Friedman uzyskał B. Sc. W Tel Aviv University w 1987 roku i M. Sc. W Instytucie Weizmanna w roku 1992. W 1997 roku uzyskał Ph. D. w Stanford University pod kierunkiem Josepha Y. Halpern , w kierunek sztuczna inteligencja (tytuł pracy: "  Modelowanie przekonań w układach dynamicznych  " ).

Potem pracował jako naukowca doktora na University of California w Berkeley , a następnie dołączył do Szkoły Informatyki , Uniwersytet Hebrajski , początkowo jako docent, a następnie jako profesor.

Jego badania obejmują prace nad klasyfikatorami sieci bayesowskich (z Dannym Geigerem i Moisesem Goldszmidem), średnią strukturalną maksymalizacją bayesowską (maksymalizacja oczekiwań ) oraz zastosowaniem metod bayesowskich do analizy danych w celu ekspresji genów (z Aviv Regev  (en) , Dana Pe'er  (en) , Eran Segal  (en) , Daphne Koller i David Botstein  (en) ). Ostatnio skupił się na probabilistycznym modelu graficznym , rekonstrukcji sieci regulatorowych genów, epistazie i roli chromatyny w regulacji transkrypcji (z Oliverem Rando  (en) ).

W 2009 roku Friedman i Koller opublikowali książkę o probabilistycznych modelach graficznych . W tym samym roku został również profesorem w Instytucie Nauk Przyrodniczych i otworzył laboratorium doświadczalne z wykorzystaniem narzędzi robotycznych do badania regulacji transkrypcji startera saccharomyces cerevisiae .

Nagrody i uznanie

Nir Friedman jest wybitnym członkiem ISCB (International Society of Computational Biology) w 2014 roku. Jest laureatem nagrody Michael Bruno Memorial Award (2010) oraz stypendystą European Research Council (2009–2014); otrzymał także Juludan Prize (2007) i stypendium Sir Zelman Cowen Universities Fund (2007)

Uwagi i odniesienia

(fr) Ten artykuł jest częściowo lub w całości zaczerpnięty z artykułu w angielskiej Wikipedii zatytułowanego „  Nir Friedman  ” ( zobacz listę autorów ) .
  1. „  Nir Friedman  ” , w Cs.huji.ac.il (dostęp 25 maja 2016 ) .
  2. „  Nir Friedman's Lab  ” w Systemsbio.cs.huji.ac.il (dostęp 25 maja 2016 ) .
  3. „  Curriculum Vitae - Nir Friedman  ” , w Cs.huji.ac.il (dostęp 25 maja 2016 ) .
  4. „Archiwalna kopia pracy” (wersja z 25 kwietnia 2012 r. W Internet Archive )
  5. (w) „  Nir Friedman  ” na stronie Mathematics Genealogy Project
  6. „  The Rachel and Selim Benin School of Computer Science and Engineering  ” , na Cs.huji.ac.il (dostęp 25 maja 2016 )
  7. „  Nir Friedman - Google Scholar  ” , na Scholar.google.com (dostęp 25 maja 2016 )
  8. N. Friedman w PubMedAuthorSearch.
  9. „  Bayesian network klasyfikatory  ” , Cs.huji.ac.il (dostęp: 25 maja 2016 r. )
  10. „  Bayesian strukturalny algorytm EM  ” , na stronie Cs.huji.ac.il (dostęp: 25 maja 2016 )
  11. N. Friedman , M. Linial , I. Nachman i D. Pe'er , „  Using Bayesian Networks to Analyze Expression Data  ”, Journal of Computational Biology , tom.  7, n kość  3-4, 2000, s.  601–620 ( PMID  11108481 , DOI  10.1089 / 106652700750050961 )
  12. E. Segal , M. Shapira , A. Regev , D. Pe'er , D. Botstein , D. Koller i N. Friedman , „  Sieci modułów: Identyfikowanie modułów regulacyjnych i ich regulatorów specyficznych dla stanu na podstawie danych dotyczących ekspresji genów  ”, Nature Genetics , tom.  34 N O  2 2003, s.  166-176 ( PMID  12740579 , DOI  10.1038 / ng1165 )
  13. N. Friedman , „  Inferring Cellular Networks Using Probabilistic Graphical Models  ”, Science , vol.  303 n O  5659, 2004, s.  799–805 ( PMID  14764868 , DOI  10.1126 / science.1094068 )
  14. E. Segal , N. Friedman , D. Koller i A. Regev , „  Mapa modułów pokazująca warunkową aktywność modułów ekspresji w raku  ”, Nature Genetics , tom.  36 N O  10, 2004, s.  1090–1098 ( PMID  15448693 , PMCID  2271138 , DOI  10.1038 / ng1434 )
  15. „  Nir Friedman (publikacje)  ” , Cs.huji.ac.il (dostęp 25 maja 2016 )
  16. Nir Friedman i Daphne Koller, Probabilistyczne modele graficzne: zasady i techniki , MIT Press , 2009, 1231  s. ( ISBN  978-0-262-01319-2 , czytaj online ).
  17. „  The Alexander Silberman Institute of Life Sciences  ” , w Bio.huji.ac.il (dostęp 25 maja 2016 ) .
  18. „  Robotic Facility  ” w Systemsbio.cs.huji.ac.il (dostęp 25 maja 2016 )
  19. Lista stypendystów ISCB .
  20. „  Nir Friedman - Yad Hanadiv  ” , na Yadhanadiv.org.il (dostęp 25 maja 2016 )
  21. "  Młody biolog HU zdobywa australijską nagrodę  " , The Jerusalem Post - JPost.com (dostęp 25 maja 2016 ) .

Linki zewnętrzne