W mitochondriach macierz mitochondrialna nazywana jest pożywką, ograniczoną wewnętrzną błoną mitochondrialną , która zawiera rybosomy , materiał genetyczny i rozpuszczalne enzymy zaangażowane w produkcję acetylo-CoA - β-oksydacji , kompleksu dehydrogenazy pirogronianowej - i utleniania tego metabolit - cykl Krebsa .
Termin „matryca” wynika z faktu, że medium jest znacznie bardziej lepka niż w cytoplazmie , w wodzie zawartość około 0,8 ul · mg -1 od białek w matrycy z około 3,8 ul · mg - 1 białka w cytoplazmie.
Nie wiadomo, w jaki sposób mitochondria utrzymują równowagę osmotyczną w poprzek wewnętrznej błony mitochondrialnej; jednak ta ostatnia zawiera akwaporyny , które regulują przepływ przez nią wody. PH mitochondrialnego matrycy wynosi około 7,8.
Łańcuch oddechowy przebiega w wypukłości wewnętrznej błony mitochondrialnej z wysoką przeniesienia ewentualnych elektrony z NADH i FADH 2 powstały podczas utleniania cyklu Krebsa, które zachodzą w matrycy.