W patologii roślin , antagonizm odnosi się do działania w organizmie żywym , które hamuje normalny wzrost i aktywność, lub zakłóca nich z patogenów roślin . Dzieje się tak w przypadku dużej liczby bakterii lub grzybów .
Organizmy te mogą być używane do zwalczania szkodników i nazywane są „ biologicznymi środkami kontroli ”. Mogą to być drapieżniki , pasożyty , parazytoidy lub patogeny atakujące szkodniki , chwasty lub choroby roślin lub innych organizmów w ich pobliżu. Substancja hamująca jest często bardzo specyficzna w swoim działaniu, wpływając tylko na jeden określony gatunek. Wiele mikroorganizmów z gleby jest antagonistycznych. Wydzielają silny enzym, który niszczy inne komórki trawiąc ich ściany komórkowe i rozkładając zawartość komórek, a uwolniony materiał protoplazmatyczny służy jako składnik odżywczy dla organizmu hamującego. Na przykład w przypadku grzybów Penicillium Restrykum działa antagonistycznie na wiele fitopatogennych grzybów . Szczepy Trichoderma spp. wykazali również działanie antagonistyczne na grzyby botrytis cinerea odpowiedzialne za szarą zgniliznę .