H2AFY
H2AFY
|
|
Główne cechy |
---|
Symbol
|
H2AFY
|
---|
Synonimy
|
H2AFY, H2A.y, H2A / y, H2AF12M, H2AFJ, MACROH2A1.1, mH2A1, macroH2A1.2, H2A członek rodziny histonów Y
|
---|
|
Umiejscowienie
|
5 q31.1
|
---|
Histon serca makro-H2A.1 jest białkiem kodowanym przez gen H2AFY u ludzi .
Funkcjonować
W histony są białka podstawowej struktury atomowej odpowiedzialne za nukleosomalne włókna chromosomową w komórkach eukariotycznych . Nukleosomy składają się z około 146 pz DNA owiniętego wokół oktameru histonu złożonego z par każdego z czterech głównych histonów (H2A, H2B, H3 i H4). Włókno chromatyny jest następnie zagęszczane przez interakcję wiążącego histonu H1 z międzynukleosomalnym DNA, tworząc struktury chromatyny wyższego rzędu. Ten gen koduje członka rodziny histonów H2A. Jest to wariant histonu, który zastępuje konwencjonalne histony H2A w podzbiorze nukleosomów, gdzie tłumi transkrypcję i uczestniczy w stabilnej inaktywacji chromosomu X. Alternatywne składanie tego transkryptu skutkuje kilkoma wariantami transkrypcji kodującymi różne izoformy. Ekspresja tych izoform jest związana z kilkoma nowotworami, takimi jak rak wątrobowokomórkowy.
Bibliografia
-
„ Identyfikacja genów wyrażanych w ludzkich hematopoetycznych komórkach macierzystych / progenitorowych CD34 (+) przez eksprymowane znaczniki sekwencji i wydajne klonowanie cDNA o pełnej długości ”, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , vol. 95 N O 14Lipiec 1998, s. 8175-80 ( PMID 9653160 , PMCID 20949 , DOI 10,1073 / pnas.95.14.8175 )
-
„ Izolacja klonów cDNA kodujących ludzkie podtypy histonów makroH2A1 ”, Biochimica and Biophysica Acta , vol. 1399 n o 1,Lipiec 1998, s. 73–7 ( PMID 9714746 , DOI 10.1016 / s0167-4781 (98) 00098-0 )
-
„ Enter Gene: H2AFY H2A rodzina histonów, członek Y ”
-
„ Immunopozytywność dla izoform histonów makroH2A1 oznacza raka wątrobowokomórkowego związanego ze stłuszczeniem ”, PLOS ONE , vol. 8, N O 1,2013, e54458 ( PMID 23372727 , PMCID 3553099 , DOI 10.1371 / journal.pone.0054458 )
Dodatkowa biobliografia
- El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA, „ Transkrypcyjna aktywacja zintegrowanego promotora ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1 związanego z chromatyną ”, Molecular and Cellular Biology , vol. 18 N O 5,Maj 1998, s. 2535–44 ( PMID 9566873 , PMCID 110633 , DOI 10.1128 / mcb.18.5.2535 )
- Costanzi C, Pehrson JR, „ Histone macroH2A1 jest skoncentrowany w nieaktywnym chromosomie X samic ssaków ”, Nature , vol. 393 n O 6685,Czerwiec 1998, s. 599–601 ( PMID 9634239 , DOI 10.1038 / 31275 )
- Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z, „ Klonowanie i analiza funkcjonalna cDNA z otwartymi ramkami odczytu dla 300 wcześniej niezdefiniowanych genów wyrażanych w hematopoetycznych komórkach macierzystych / progenitorowych CD34 + ”, Genome Research , tom. 10 N O 10,Październik 2000, s. 1546–60 ( PMID 11042152 , PMCID 310934 , DOI 10.1101 / gr.140200 )
- Deng L, de la Fuente C, Fu P, Wang L, Donnelly R, Wade JD, Lambert P, Li H, Lee CG, Kashanchi F, „ Acetylacja HIV-1 Tat przez CBP / P300 zwiększa transkrypcję zintegrowanego wirusa HIV-1 genom i wzmacnia wiązanie z rdzeniowymi histonami ”, Virology , vol. 277 n O 2listopad 2000, s. 278–95 ( PMID 11080476 , DOI 10.1006 / viro.2000.0593 )
- Chadwick BP, Willard HF, „ Warianty Histone H2A i nieaktywny chromosom X: identyfikacja drugiego wariantu makroH2A ”, Human Molecular Genetics , tom. 10 N O 10,Maj 2001, s. 1101–13 ( PMID 11331621 , DOI 10,1093 / hmg / 10.10.1101 )
- Deng L, Wang D, de la Fuente C, Wang L, Li H, Lee CG, Donnelly R, Wade JD, Lambert P, Kashanchi F, » Enhancement of the p300 HAT activity by HIV-1 Tat on chromin DNA «, Virology , vol. 289 n O 2Październik 2001, s. 312–26 ( PMID 11689053 , DOI 10.1006 / viro.2001.1129 )
- Chadwick BP, Willard HF, „ Zależna od cyklu komórkowego lokalizacja makroH2A w chromatynie nieaktywnego chromosomu X ”, The Journal of Cell Biology , tom. 157 n O 7,Czerwiec 2002, s. 1113–23 ( PMID 12082075 , PMCID 2173542 , DOI 10.1083 / jcb.200112074 )
- Takahashi I, Kameoka Y, Hashimoto K, „ MacroH2A1.2 wiąże białko jądrowe Spop ”, Biochimica and Biophysica Acta , vol. 1591 n kość 1-3,sierpień 2002, s. 63–8 ( PMID 12183056 , DOI 10.1016 / S0167-4889 (02) 00249-5 )
- Ganesan S, Silver DP, Greenberg RA, Avni D, Drapkin R, Miron A, Mok SC, Randrianarison V, Brodie S, Salstrom J, Rasmussen TP, Klimke A, Marrese C, Marahrens Y, Deng CX, Feunteun J, Livingston DM , „ BRCA1 wspiera stężenie XIST RNA na nieaktywnym chromosomie X ”, Cell , vol. 111 n O 3,Listopad 2002, s. 393–405 ( PMID 12419249 , DOI 10.1016 / S0092-8674 (02) 01052-8 )
- Angelov D, Molla A, Perche PY, Hans F, Côté J, Khochbin S, Bouvet P, Dimitrov S, „ The histone variant macroH2A interfering with transcription factor binding and SWI / SNF nucleosome remodeling ”, Molecular Cell , vol. 11 N O 4,kwiecień 2003, s. 1033–41 ( PMID 12718888 , DOI 10.1016 / S1097-2765 (03) 00100-X )
- Behrends U, Schneider I, Rössler S, Frauenknecht H, Golbeck A, Lechner B, Eigenstetter G, Zobywalski C, Müller-Weihrich S, Graubner U, Schmid I, Sackerer D, Späth M, Goetz C, Prantl F, Asmuss HP, Bise K, Mautner J, „ Novel tumor antigens identified by autologous antiging screening of child medulloblastoma cDNA libraries ”, International Journal of Cancer , vol. 106 n O 2sierpień 2003, s. 244–51 ( PMID 12800201 , DOI 10.1002 / ijc.11208 )
- Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M, „ Regulacja ekspresji genów HIV-1 przez acetylację histonów i rekrutację czynników w promotorze LTR ”, The EMBO Journal , vol. 22 N O 24,grudzień 2003, s. 6550–61 ( PMID 14657027 , PMCID 291826 , DOI 10.1093 / emboj / cdg631 )
- Acín-Pérez R, Bayona-Bafaluy MP, Fernández-Silva P, Moreno-Loshuertos R, Pérez-Martos A, Bruno C, Moraes CT, Enríquez JA, „ Kompleks oddechowy III jest niezbędny do utrzymania kompleksu I w mitochondriach ssaków ”, Molecular Cell , vol. 13 N O 6,Marzec 2004, s. 805-15 ( PMID 15053874 , PMCID 3164363 , DOI 10.1016 / S1097-2765 (04) 00124-8 )
- Zhang R, Poustovoitov MV, Ye X, Santos HA, Chen W, Daganzo SM, Erzberger JP, Serebriiskii IG, Canutescu AA, Dunbrack RL, Pehrson JR, Berger JM, Kaufman PD, Adams PD, „ Formation of MacroH2A-complex senescence- powiązane ogniska heterochromatyny i starzenie się napędzane przez ASF1a i HIRA ”, Developmental Cell , tom. 8, N O 1,styczeń 2005, s. 19–30 ( PMID 15621527 , DOI 10.1016 / j.devcel.2004.10.019 )
- Hernández-Muñoz I, Lund AH, van der Stoop P, Boutsma E, Muijrers I, Verhoeven E, Nusinow DA, Panning B, Marahrens Y, van Lohuizen M, „ Stabilna inaktywacja chromosomu X obejmuje kompleks PRC1 Polycomb i wymaga histonu MACROH2A1 oraz ligaza ubikwityny E3 CULLIN3 / SPOP ”, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , vol. 102 n O 21Maj 2005, s. 7635–40 ( PMID 15897469 , PMCID 1140410 , DOI 10.1073 / pnas.0408918102 )
- Youdinkova ES, Barat A, Pichugin A, Markova E, Sklyar I, Pirozhkova I, Robin C, Lipinski M, Ogryzko V, Vassetzky YS, Razin SV, „ Wyraźna dystrybucja wyrażonych ektopowo wariantów histonów H2A.Bbd i MacroH2A w otwartych i zamkniętych domeny chromatynowe ”, PLOS ONE , t. 7, n O 10,2012, e47157 ( PMID 23118866 , PMCID 3484066 , DOI 10.1371 / journal.pone.0047157 )