Kodon stop , kodonu terminacji , lub kodon nonsens jest jednym z trzech kodonów (z 64 kodonów kod genetyczny ), które odróżniają się koniec translacji mRNA do białka . Zwykle nigdy nie podlega translacji, ponieważ nie ma odpowiedniego transferowego RNA . Kodon UGA może jednak, w wyjątkowych przypadkach selenoprotein , kodować selenocysteinę ; ten rzadki aminokwas jest następnie włączany za pomocą dodatkowych sygnałów obecnych na informacyjnym RNA i określonym transferowym RNA. Podobnie, wykazano, że w pewnych metanogennego archeonów The UAG kodon może kodować resztę aminokwasu , pirolizyna . Mutacja punktowa, która powoduje powstanie kodonu stop, nazywana jest mutacją nonsensowną .
Trzy kodony stop to:
Kiedy rybosom dociera do kodonu stop, ten ostatni oddziałuje z czynnikami terminacji lub RF ( czynnikiem uwalniającym ) w miejscu A. To wyzwala kaskadę zdarzeń prowadzących do hydrolizy wiązania estrowego między zakończonym białkiem a końcem 3'-OH. tRNA przyłączonego do ostatniego kodonu. U bakterii istnieją dwa czynniki kończące rozpoznawanie 3 kodonów stop, RF1 i RF2.
Mutacje w genach tRNA mogą modyfikować sekwencję ich antykodonu , w konsekwencji czego staje się on komplementarny do kodonu stop. Te tRNA nazywane są nonsensownymi supresorowymi tRNA (w skrócie supresorowymi tRNA). W określonych warunkach te tRNA umożliwiają translację kodonów stop, w szczególności tych, które wynikają z mutacji genów kodujących białka.
Nazwa kodonu bursztynowego pochodzi z 1960 roku i pochodzi z badań genetyki bakteriofaga T4. Podstawową metodą genetyki jest poszukiwanie mutacji i związanych z nimi supresorów . W ramach takich badań, student Caltech w Pasadenie, Harris Bernstein, został zwerbowany do przeprowadzenia izolacji określonych mutacji z linii bakterii w zamian za pozwolenie na nazwanie odkrytych mutacji. Praca nad wykonaniem tych izolacji wymaga posiewu i analizy setek kultur bakteryjnych na szalkach Petriego . Harris Bernstein nie podał swojego nazwiska bezpośrednio na mutacje, które wyodrębnił, ale swoje tłumaczenie na język angielski: Amber (Amber). W 1965 roku nazwę ochra nadano innemu zestawowi mutacji, które nie miały tego samego supresora. Charakter mutacji, pojawienie się kodonów stop UAG i UAA, zidentyfikowano jedynie po ich nazwie. Nazwa opal pojawiła się w 1967 roku wraz z identyfikacją nowego zestawu mutacji charakteryzujących się pojawieniem się kodonu UGA.