Mapowanie genetyczne

Mapowanie genetyczne jest wykonanie na karcie jest zlokalizowane około się gen lub szeroką podstawę na genomu całkowitej. Mówiąc bardziej ogólnie, jest to określenie pozycji locus ( genu lub markera genetycznego ) na chromosomie jako funkcja szybkości rekombinacji genetycznej . Jednostką odległości jest centymorgan (cM).

Cel mapowania genetycznego

Czynność mapowania obejmuje określenie względnych pozycji loci (genów lub sekwencji DNA) na chromosomie . Mapy powiązań uzyskuje się na podstawie częstotliwości rekombinacji między loci . Mapy fizyczne uzyskuje się na ogół przy użyciu hybrydyzacji in situ fragmentów DNA sklonowanych z chromosomami metafazowymi lub przy użyciu hybryd somatycznych lub hybryd napromieniowanych.

Historia mapowania genetycznego

Pierwsza mapa genetyczna została wykonana w 1913 roku przez Thomas Hunt Morgan i Alfred Sturtevant na chromosomie X z Drosophila . Pierwszą zmapowaną rośliną była kukurydza w 1935 roku przy użyciu techniki markerów fenotypowych. Technika znakowania molekularnego jest znacznie nowsza.

Rodzaje kart

Mapa będąca diagramem przedstawiającym względne położenie loci na chromosomie i odległości między nimi wyróżniamy następujące typy map:

W cytologiczne mapy genów związanych z mutacjami można przy pewnych mutacji chromosomalnych ma podłoże, które można wykryć za pomocą barwienia techniki paski chromosomów.

Rodzaje map

Mapowanie porównawcza jest porównanie położenia genów i markerów na mapie chromosomu pomiędzy gatunkami . W porównaniach między blisko spokrewnionymi gatunkami znajdujemy wysoki stopień ochrony:

W takim przypadku lokalizację kilku genów można przewidzieć za pomocą modelu danych. Porównania między odległymi filogenetycznie gatunkami ujawniają wzrost utraty syntenii.

Mapowanie S1 jest sposób charakteryzowania posttranscriptionelles zmian w RNA ( splicing z intronami , etc.) przez hybrydyzację z RNA z DNA jednoniciowy i traktowanie nukleazą S1.

Uwagi i odniesienia

  1. Liniowy układ sześciu czynników związanych z płcią u Drosophila , jak pokazano na podstawie ich sposobu skojarzenia [PDF] Journal of Experimental Zoology , 14: 43-59, 1913