Pudełko TATA

TATA ( TATA i Goldberg-Hogness okno w języku angielskim) jest sekwencją DNA (a elementu regulacyjnego cis ) obecny na poziomie sekwencji promotora części genów organizmów eukariotycznych . Ta sekwencja DNA kodowana przez TATA jest zlokalizowana około 25 nukleotydów powyżej pierwszego transkrybowanego nukleotydu (N + 1). Sekwencja ta służy po części jako miejsce rozpoznawania polimerazy RNA u eukariotów.

U prokariotów istnieje również inny zestaw sekwencji odgrywających podobną rolę. Składa się z sekwencji znajdującej się 35 nukleotydów powyżej pierwszego transkryptu: nazywany jest „kasetą -35” (ramka Pribnowa). I sekwencja znajdująca się w polu -10, zwana „skrzynką -10”. Zatem TATAAT box (-10) zaczyna się 10 nukleotydów przed pierwszym transkrypcją.

Umiejscowienie skrzynki Pribnow i „skrzynki -35” na promotorze prokariotycznym  :

<-- amont aval --> 5'-XXXXXXXPPPPPXXXXXXPPPPPPXXXXGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGXXXX-3' -35 -10 +1 gène d'intérêt TTGACA TATAAT

Lokalizacja skrzynki TATA u eukariontów  :

5'-XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXPPPPXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG-3' -30 gène d'intérêt TATA box

Uwagi i odniesienia

  1. (en) Lifton RP, Goldberg L., Karp RW, DS Hogness. (1978) „  Organizacja genów histonów u Drosophila melanogaster: implikacje funkcjonalne i ewolucyjne  ” Cold Spring Harb Symp Quant Biol . 42, 1047-1051. PMID 98262
  2. (w) Smale ST Kadonaga JT (2003) "  Promotor rdzenia polimerazy II RNA  " Annu Rev Biochem. 72, 449-479. PMID 12651739 PDF
  3. (in) C Yang , E Bolotin , T Jiang , FM Sladek i E Martinez , "  Przewaga inicjatora nad kasetą TATA w genach ludzkich i drożdżowych oraz identyfikacja motywów DNA wzbogaconych w ludzkie promotory rdzeniowe bez TATA  " , Gene , lot.  389 n o  1,2007, s.  52–65 ( PMID  17123746 , PMCID  1955227 , DOI  10.1016 / j.gene.2006.09.029 )
  4. (en) Carninci P, Sandelin A, B. Lenhard i wsp. , „  Analiza całego genomu architektury i ewolucji promotorów ssaków  ” , Nat. Miotła. , vol.  38, n o  6,czerwiec 2006, s.  626–35 ( PMID  16645617 , DOI  10.1038 / ng1789 )
  5. (en) Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J. i in. , „  Identyfikacja i charakterystyka potencjalnych regionów promotorowych 1031 rodzajów genów ludzkich  ” , Genome Res. , vol.  11 N O  5,Maj 2001, s.  677–84 ( PMID  11337467 , PMCID  311086 , DOI  10.1101 / gr.164001 )