Anthropology cząsteczkowa jest pole antropologii w którym biologii molekularnej stosuje się do określenia rozwoju relacji pomiędzy starym i współczesnych populacji ludzkich i pomiędzy gatunkami. Ogólnie porównuje się sekwencje DNA lub białek . W pierwszych badaniach wykorzystano również serologię porównawczą.
Badając w szczególności sekwencje DNA w różnych populacjach, naukowcy mogą określić bliskość pokrewieństwa i różnice między populacjami. Zostało to wykorzystane w szczególności w przypadku Homo sapiens . Pewne podobieństwa w składzie genetycznym pozwalają antropologom molekularnym określić, czy różne grupy ludzi należą do tej samej haplogrupy , a zatem czy mają wspólne pochodzenie geograficzne. Pozwala to antropologom prześledzić wzorce migracji i osadnictwa, zapewniając wgląd w to, jak współczesne populacje tworzyły się i rozwijały w czasie.
Antropologia molekularna łączy kilka pokrewnych dyscyplin:
Każda z tych dyscyplin obejmuje ogólnie żywe istoty. Jedynie ich gałęzie poświęcone badaniu człowieka należą do antropologii molekularnej.