Satelitarne DNA

Satelitarnego DNA jest typ powtarzających się sekwencji DNA .

Kompozycja

DNA satelitarne występuje jako sekwencje DNA o długości do kilku milionów par zasad, składające się z dużej liczby powtórzeń o znacznie mniejszej sekwencji ( jednostka powtórzeń ). Długość powtarzającej się jednostki różni się w zależności od typu satelitarnego DNA, od 5 par zasad dla ludzkich satelitów III do 755 par zasad dla satelitów znalezionych w genomach roślin.

Nazwa „satelitarne DNA” pochodzi od faktu, że DNA tych sekwencji, ze względu na ich powtarzalny charakter, ma silnie tendencyjny skład nukleotydów w stosunku do reszty genomu; w konsekwencji inaczej osadza się w wyniku ultrawirowania (akumulacja w probówce wirówki w miejscu, które zależy dokładnie od jej gęstości) i tworzy wtórne pasmo, zwane „satelitą”, w gradiencie chlorku cezu .

Ludzki genom

Ludzki genom zawiera około 7% satelitarnego DNA.

DNA Α-satelity (zwane także w języku angielskim alfoidalnym DNA ) składa się z powtórzeń o wzorze 171 par zasad. Występuje na poziomie centromeru wszystkich chromosomów , gdzie obejmuje regiony od kilkuset kilozasad do kilku megazasad - liczba powtórzeń i całkowity rozmiar są różne w zależności od chromosomu i osobnika. DNA satelity a przyczynia się do funkcji centromeru, w szczególności poprzez umożliwienie rekrutacji białka CENP-B ( białko centromerowe B ) poprzez konserwatywny motyw o 17 parach zasad. Niemniej jednak nie jest to istotne dla dobrego funkcjonowania centromeru, gdyż w pełni funkcjonalne neocentromery można obserwować w regionach genomu pozbawionych α-satelitów.

DNA Β-satelity składa się z powtórzeń wzoru 68 par zasad. Rozprzestrzenia się w regionach o wielkości od 50 do 300 kilozasad na krótkich ramionach chromosomów akrocentrycznych (chromosomy 13, 14, 15, 21 i 22), na pericentromerach chromosomów 1, 3 i 9, a także na długim ramieniu chromosomu Y.

DNA satelity III składa się z powtórzeń motywu 5 par zasad (GGAAT), zajmujących kilkaset kilozasad w regionie pericentromerycznym większości chromosomów.

Genom mysi

DNA satelitarne stanowi około 3,5% genomu mysiego i jest związane z regionami centromerycznymi i pericentromerycznymi wszystkich chromosomów. Istnieją dwa rodzaje:

Uwagi i odniesienia

  1. Richard, Kerrest i Dujon 2008
  2. (w) SaulKit, „  Równowaga sedymentacyjna w gradientach gęstości preparatów DNA z tkanek zwierzęcych  ” , Journal of Molecular Biology , vol.  3 N O  6,grudzień 1961, s.  711–716 ( DOI  10.1016 / S0022-2836 (61) 80075-2 ).
  3. Sullivan, Schwartz i Willard 1996
  4. Karpen i Allshire 1997
  5. Waye i Willard 1989
  6. Meneveri i in. 1993
  7. Konsorcjum sekwencjonowania genomu myszy 2002
  8. Hörz i Altenburger 1981
  9. Wong i Rattner 1988

Zobacz też

Bibliografia