Michał wodnik

Michał wodnik Michael Waterman w 2004 roku Kluczowe dane

Imię urodzenia	Michael Spencer Wodnik
Narodziny	28 czerwca 1942 Coquille (Oregon)
Obszary	Bioinformatyka Prawdopodobieństwo Statystyka Informatyka Matematyka dyskretna Kombinatoryczny
Instytucje	Narodowe Laboratorium Los Alamos Uniwersytetu Południowej Karoliny Uniwersytet Stanowy w Idaho
Dyplom	Uniwersytet Stanowy Oregonu Uniwersytet Stanowy Michigan
Kierownik	John Rankin Kinney
Znany z	Algorytm Smitha-Watermana Apartament De Bruijna
Nagrody	Stypendium Guggenheima (1995) Międzynarodowa Nagroda Fundacji Gairdnera (2002) Stypendium ISCB (2009) Nagroda Dana Davida (2015)
Teren	dornsife.usc.edu/labs/msw/

Michael Spencer Waterman (ur.28 czerwca 1942) Jest profesor z Biologii , Matematyki i Informatyki na Uniwersytecie Południowej Kalifornii (USC), gdzie przechowuje Associate Chair nauk biologicznych, matematyki i informatyki. Wcześniej Zajmował stanowiska w Narodowym Laboratorium Los Alamos i Uniwersytecie Stanowym Idaho .

Biografia

Dorastał w pobliżu Bandon w stanie Oregon i otrzymał tytuł licencjata z matematyki na Uniwersytecie Stanowym Oregon , a następnie doktorat ze statystyki i prawdopodobieństwa na Uniwersytecie Stanowym Michigan w 1969 roku .

Badania i kariera

Waterman jest jednym z założycieli i liderów w dziedzinie bioinformatyki . Koncentruje się na zastosowaniu matematyki, statystyki i technik komputerowych do rozwiązywania różnych problemów biologii molekularnej . Jego praca przyczyniła się do opracowania niektórych z najczęściej używanych narzędzi w tej dziedzinie, w szczególności algorytmu Smitha-Watermana (opracowanego z Temple F. Smith ), który jest podstawą wielu programów dopasowywania sekwencji.
W 1988 Waterman i Eric Lander opublikowali przełomowy artykuł opisujący matematyczny model dopasowania genomu. Praca ta stanowiła jeden z teoretycznych fundamentów wielu kolejnych projektów mapowania i sekwencjonowania DNA, w szczególności Projektu Genomu Ludzkiego . W 1995 roku wraz z firmą Idury firma Waterman wprowadziła koncepcję składania DNA przy użyciu wykresów De Bruijna Euleriena , koncepcji, która nadal jest stosowana do składania danych sekwencjonowania drugiej generacji .

Wraz z Pavlem A. Pevznerem (byłym badaczem podoktoranckim w jego laboratorium) stworzył międzynarodową konferencję Research in Computational Molecular Biology (RECOMB) i jest jednym z redaktorów założycieli Journal of Computational Biology . Wreszcie Waterman jest autorem jednego z pierwszych podręczników z tej dziedziny: Wprowadzenie do biologii obliczeniowej .

Wyróżnienia i wyróżnienia

W 2011 roku otrzymał doktorat honoris causa Uniwersytetu w Tel Awiwie . W 2013 roku otrzymał tytuł doktora honoris causa Uniwersytetu Południowej Danii .

W 2015 roku wraz z Cyrusem Chothią i Davidem Hausslerem otrzymał Nagrodę Dana Davida za wkład w dziedzinę bioinformatyki .

Był Fellow of American Academy of Arts and Sciences od 1995 roku, Fellow of National Academy United States of Engineering od 2012, pracownik z Chińskiej Akademii Nauk od 2013 roku, Fellow w Narodowej Akademii Nauk Stany Zjednoczone od 2001 roku. Od 2005 roku jest akademikiem Francuskiej Akademii Nauk .

Został wybrany przez International Society for Computational Biology na kolegę ISCB w 2009 roku iw tym samym roku otrzymał nagrodę ISCB Senior Scientist Award.

Życie osobiste

Waterman opisany w swoich pamiętnikach (zatytułowanym Getting outide ) swoje dzieciństwo w odosobnionym ranczu w południowym wybrzeżu Oregonu w połowie XX th  wieku.

Bibliografia

1. Amerykańscy mężczyźni i kobiety nauki, Thomson Gale 2005
2. (w) „  Michael Waterman  ” , na stronie Mathematics Genealogy Project
3. Anon, „  Michael S. Waterman: profesor nauk biologicznych, matematyki, informatyki na Uniwersytecie Południowej Kalifornii  ” , na stronie dornsife.usc.edu/labs/msw ,2017
4. Anon, „  Stypendyści ISCB  ” [ archiwum20 marca 2017 r.] , na iscb.org , International Society for Computational Biology ,2017
5. Anon, „  Współzałożyciel Wikipedii Jimmy Wales wśród laureatów Nagrody Dana Davida 2015  ” , na stronie eurekalert.org ,2015(dostęp 13 lutego 2015 )
6. M. Maisel , „  Wyróżnienia ISCB Michael S. Waterman i Mathieu Blanchette  ”, PLOS Computational Biology , tom.  2, n O  8,2006, e105 ( PMCID  1526462 , DOI  10.1371 / journal.pcbi.0020105 , Bibcode  2006PLSCB ... 2..105M )
7. Michael Waterman , Wyjście na zewnątrz: dalekowschodnie dzieciństwo , Niezależna platforma wydawnicza CreateSpace,2016, 268  s. ( ISBN  978-1-5309-2934-4 )
8. „  Michael Waterman – The Mathematics Genealogy Project  ” , na stronie www.genealogy.math.ndsu.nodak.edu (dostęp 15 marca 2018 r. )
9. (w) Waterman, Michael Spencer, „  Niektóre właściwości ergodycznych wielowymiarowych rozszerzeń F  ” ,1969(dostęp 15 marca 2018 )
10. RM Idury i MS Waterman , „  Nowy algorytm składania sekwencji DNA  ”, Journal of Computational Biology: A Journal of Computational Molecular Cell Biology , tom.  2 n O  21995, s.  291-306 ( ISSN  1066-5277 , PMID  7497130 , DOI  10.1089 / cmb.1995.2.291 , czytaj online , dostęp 15 marca 2018 )
11. Anon, „  Seria konferencji RECOMB  ” , na recomb.org ,2017.
12. Waterman, Michael S., Wstęp do biologii obliczeniowej: mapy, sekwencje i genomy , Londyn, Chapman & Hall ,1995( ISBN  0-412-99391-0 )
13. „Doktor philosophiae honoris causa” na Uniwersytecie w Tel Awiwie .
14. „Protokół ze spotkania wydziałowego 13 września 2013 r.” na Uniwersytecie Południowej Danii .
15. „Michael Spencer Waterman” w Amerykańskiej Akademii Sztuki i Nauki
16. „Profesor-Michael-S-Waterman” w Narodowej Akademii Inżynierii USA .
17. „Michael S Waterman” w Chińskiej Akademii Nauk
18. „Michael S. Waterman” w Narodowej Akademii Nauk USA .
19. „Michael Waterman” na Académie des sciences (Francja) .
20. (w) Merry Maisel , „  Wyróżnienie ISCB Michael S. Waterman i Mathieu Blanchette  ” , PLoS Computational Biology , tom.  2, n O  8,4 sierpnia 2006 r., e105 ( ISSN  1553-7358 , DOI  10.1371 / journal.pcbi.0020105 , czytaj online , dostęp 15 marca 2018 )