Narodowe Centrum Informacji Biotechnologicznej

Narodowe Centrum Informacji Biotechnologicznej Logo NCBI przywołuje podwójną helisę DNA . Obraz w Infobox. Historia
Fundacja 4 listopada 1988
Rama
Akronim (en)  NCBI
Rodzaj Instytut badawczy , baza biologiczna , biblioteka danych
Siedzenie Bethesda
Kraj  Stany Zjednoczone
Informacje kontaktowe 38 ° 59 ′ 45 ″ N, 77 ° 05 ′ 56 ″ W.
Organizacja
Organizacja macierzysta Narodowa Biblioteka Medyczna Stanów Zjednoczonych
Stronie internetowej (en)  www.ncbi.nlm.nih.gov

National Center for Biotechnology Information ( NCBI ), po francusku "  amerykański Centrum Informacji dla Biotechnologii  ", to amerykański Krajowy Instytut molekularnej informacji biologicznej .

Organizacja ta, założona w 1988 roku i zlokalizowana w Bethesda w stanie Maryland , jest częścią Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , jednego z Instytutów Zdrowia Stanów Zjednoczonych .

Misje

NCBI prowadzi badania z zakresu biologii obliczeniowej, opracowuje oprogramowanie do analizy danych genomu i dostarcza informacji biomedycznych.

NCBI nie jest bazą danych, ale rozwija również publiczne bazy danych, takie jak:

Jest to w pewnym sensie amerykański odpowiednik Europejskiego Instytutu Bioinformatyki (EBI).

NCBI oferuje i zawiera bazę danych taksonomii NCBI, która ma jedynie charakter informacyjny. Strona internetowa NCBI określa, że ​​ta baza danych nie jest wiarygodnym źródłem nomenklatury lub klasyfikacji, i że należy zapoznać się z odpowiednią literaturą naukową, aby uzyskać najbardziej wiarygodne informacje. Taksonomia NCBI reprezentuje około 10% żywych gatunków na naszej planecie. Ta taksonomia jest klasyfikacją wyselekcjonowaną i jest proponowana jako zorganizowana nomenklatura sekwencji organizmów w publicznych bazach danych. Taxid (unikalny identyfikator w taksonomii NCBI) służy jako łącznik między trzech bazach danych współpracy międzynarodowej sekwencji nukleotydów (INSDC „Międzynarodowa współpraca w sekwencji nukleotydowej bazy danych ”), którego DNA danych Bank of Japan jest członkiem. ( DDBJ), NCBI (USA) i Europejski Instytut Bioinformatyki (EMBL-EBI, Europa).

Uwagi i odniesienia

  1. (in) „  Zastrzeżenie: Baza danych taksonomii NCBI nie jest autorytatywnym źródłem nomenklatury ani klasyfikacji - należy zapoznać się z odpowiednią literaturą naukową, aby uzyskać najbardziej wiarygodne informacje.  » (Zobacz stopkę w tym przykładzie badawczym ).
  2. „  Home - Taxonomy - NCBI  ” , na www.ncbi.nlm.nih.gov (dostęp 30 sierpnia 2017 )
  3. (w) Scott Federhen Karen Clark , Tanya Barrett i Helen Parkinson , „  Toward richer metadata for microbial sequences: Replacing-level NCBI taksonomy taxids with Bioproject, BioSample records and Assembly  ” , Standards in Genomic Sciences , vol.  9 N O  3,15 czerwca 2014, s.  1275 ( ISSN  1944-3277 , DOI  10.4056 / sigs.4851102 , odczyt online , dostęp 30 sierpnia 2017 )
  4. (w) "  Międzynarodowa współpraca w zakresie baz danych sekwencji nukleotydów | INSDC  ” , na www.insdc.org (dostęp 30 sierpnia 2017 )

Zobacz też

Powiązane artykuły

  • Wejdź , NCBI Global Cross-Database Search System.
  • BLAST , oprogramowanie NCBI, umożliwiające porównanie sekwencji nukleotydów i białek.
  • Lista stron Wikipedii opisujących takson z wykorzystaniem odniesienia NCBI .

Linki zewnętrzne