Globalny Ośrodek Informacji o Bioróżnorodności

Globalny Ośrodek Informacji o Bioróżnorodności Obraz w Infoboksie. Historia
Fundacja 2001
Rama
Akronim (w)  GBIF
Rodzaj Gatunki Baza danych , taksonomiczna baza danych , organizacja , infrastruktura , biblioteka danych , infrastruktura badawcza
Organizacja
Przynależność Normy informacyjne dotyczące różnorodności biologicznej ( w )
Stronie internetowej (pl)  www.gbif.org

Global Biodiversity Information Facility (GBIF), po francusku „  Globalny System Informacji o Bioróżnorodności  ” lub „ Swobodny i otwarty dostęp do danych o różnorodności biologicznej ”, to międzynarodowy projekt naukowy, założony w formiekonsorcjumprzezOECDw 2001 roku. ma na celu udostępnienie wszystkich znanych informacji na tematróżnorodności biologicznej(dane z obserwacji lub kolekcjizwierząt,roślin,grzybów,bakteriiiarcheonów).

Oczekiwano, że decyzje podjęte na Światowej Konferencji Bioróżnorodności w Nagoi w 2010 roku przyspieszą rozwój GBIF.

Utworzony w 2013 roku międzynarodowy portal danych GBIF to także otwarta platforma informatyczna z myślą o zarządzaniu dużymi ilościami danych ( big data ), badaniu i selekcji danych ( data mining ) w celu dzielenia się i otwartości ( otwarte dane ); zapewnia dostęp online do prawie miliarda obserwacji ponad 1,5 miliona gatunków. Dane te można pobrać bezpłatnie w „  otwartym dostępie  ” (po obowiązkowej i bezpłatnej rejestracji).

GBIF jest partnerem GEO. Jest to komponent bioróżnorodności bardziej globalnych programów (GEOSS; GEOBON) oraz baza do formułowania rekomendacji formułowanych przez IPBES (odpowiednik IPCC dla klimatu). „Z prawie 400 milionami danych dostępnych w marcu 2013 r. GBIF jest głównym portalem w tej dziedzinie (data.gbif.org)” .

Metoda pracy

GBIF łączy bazy danych zbiorów przyrodniczych lub obserwacji o charakterze przyrodniczym z portalem badawczym (dostępnym dla wszystkich, o ile wcześniej wyrazili zgodę na warunki korzystania).

Portal ten tworzy automatyczne mapy wskazujące aktualne i znane obszary rozmieszczenia (z możliwością przybliżenia mapy) oraz mniej lub bardziej powszechny charakter taksonu .

Dlatego wszystkie skomputeryzowane dane dotyczące przyrody powinny stopniowo stać się interoperacyjne i widoczne. Wwrzesień 2009299 dostawców danych było podłączonych do GBIF, dostarczając ponad 180 milionów danych, każdy dotyczący próbki jednokomórkowej rośliny, zwierzęcia lub organizmu .

Ponadto GBIF utrzymuje węzły w krajach członkowskich, które pomagają łączyć dane i promować projekt.

GBIF stworzył protokół do wykrywania i obsługi duplikatów i wraz z TDWG3 opracował zalecenia dotyczące tworzenia unikalnych identyfikatorów, które zaczęły być stosowane około 2010 roku.

Otwarte dane i współpraca

GBIF zachęca do współpracy i otwartej pracy naukowców, którzy mogą również korzystać z innych projektów dostarczania otwartych danych na całym świecie, które mogą wchodzić w interakcje z GBIF z czasami aplikacjami otwartymi na naukę obywatelską i pracę zespołową ( gatunki wiki ), w tym we Francji z Tela Botanica i pierwsze narzędzia opracowane w 2011 roku.

Przykłady zastosowań „dużych” danych

GBIF na przykład włączona międzynarodowego badania pokazujące jak szara wiewiórka ( Sciurus carolinensis ) native do Ameryki Północnej stał się szybko inwazyjne mając praktycznie również wymazane rodzimych populacji Wiewiórka (Sciurus vulgaris) w większości krajów świata. Wyspy Brytyjskie i Północne Włochy (skąd może dotrzeć do Francji lub reszty Europy). Dane naturalistyczne (w tym z GBIF) oraz obserwacje terenowe umożliwiły udoskonalenie i porównanie modeli rzeczywistego rozmnażania się wiewiórek inwazyjnych z modelami ich zachowania w Ameryce Północnej. W ten sposób można było zdefiniować i porównać niszę ekologiczną zwierzęcia w Ameryce i Europie oraz wykazać, że w nowym środowisku i klimacie szara wiewiórka była w stanie zmienić swoją niszę ekologiczną i skolonizować zimniejsze środowiska niż jej naturalne siedliska pochodzenia. Pokazuje to, że przewidywanie rozwoju populacji inwazyjnej wyłącznie na podstawie danych behawioralnych i biogeograficznych z regionu pochodzenia gatunku może poważnie nie docenić jego wpływu pod względem inwazyjności biologicznej w „egzotycznym” środowisku.”(Nowe); Dlatego modele badawcze powinny być używane z ostrożnością, aby tworzyć „białe listy” gatunków, co do których istnieje podejrzenie, że stwarzają jedynie niskie ryzyko inwazji.

Podobnie strategia tworzenia sieci morskich obszarów chronionych w Zatoce Kalifornijskiej (poza Meksykiem ) wykorzystywała GBIF do określenia idealnej odległości między tymi obszarami chronionymi, aby zapewnić wystarczającą łączność ekologiczną dla larw gatunków ryb zidentyfikowanych przez GBIF i jego Partner meksykański (CONABIO)

W 2012 r. meksykańscy naukowcy zbadali, w jaki sposób modele oparte na danych GBIF (lub podobnych) mogą wyjaśnić rozmieszczenie dyskretnych gatunków o małym zasięgu, aby ulepszyć strategie ochrony przyrody . Przedmiotem badań był Dendrortyx barbatus , ptak rzadko widywany żyjący w lasach strefy umiarkowanej wschodniego pasma górskiego Sierra Madre Oriental (Meksyk), sklasyfikowany jako „podatny” na Czerwonej Liście IUCN, ale „zagrożony wyginięciem” w Meksyku (po spór dotyczący nieuchronnego ryzyka wyginięcia). Mapa rozmieszczenia wykonana przez IUCN sugeruje, że metapopulacja tego gatunku dzieli się głównie na trzy małe subpopulacje oddzielone dużymi odległościami. W pierwszym badaniu porównano pięć metod wykorzystania niewielkiej liczby dostępnych zestawów danych w celu określenia rzeczywistego rozmieszczenia gatunku (odnaleziono 41 dokumentów historycznych, w tym za pośrednictwem GBIF). Modelowanie nisz ekologicznych wydaje się dawać najlepsze rezultaty pod względem pomocy i podejmowania decyzji w zakresie ochrony gatunków, zwłaszcza na ograniczonych obszarach geograficznych. W innym badaniu wykorzystano to modelowanie, aby określić, gdzie nadal istniały korzystne siedliska, i lepiej ukierunkować wykrywanie ptaków in situ (poprzez nadawanie nagranych piosenek), w tym poza obszarem, na którym uważa się, że gatunek nadal przetrwał. Umożliwiło to wykrycie 95 nowych osobników w dużej mierze poza ówczesną mapą zasięgu gatunku, potwierdzając, że gatunek jest niepozorny, ale sugerując mniejszą rzadkość niż zakładano w tym czasie. Autorzy doszli do wniosku, że ptak może nie być już klasyfikowany jako zagrożony w Meksyku, ale IUCN musi zaktualizować swoją mapę zasięgu geograficznego, jednocześnie zgadzając się, że gatunek pozostaje zagrożony.

W badaniu opublikowanym w czasopiśmie Nature wykorzystano około 47 milionów danych z prawie 30 000 gatunków (początkowo pozyskanych przez setki instytucji, a teraz dostępnychza pośrednictwemGBIF), aby lepiej zrozumieć, w jaki sposób podczas ewolucji rośliny drzewiaste i/lub kwitnące pojawiły się w środowiskach tropikalnych byli w stanie skolonizować regiony o mroźnych lub bardzo mroźnych zimach poprzez „ omijanie ” wielu problemów powodowanych przez mróz (na przykład z utratą liści, opadaniem soków, przetrwaniem zimy w formie cebulki, zmianami biochemicznymi itp.). Takie badania mogłyby następnie koncentrować się na odpowiedzi lub adaptacji roślin lub innych żywych organizmów na inne rodzaje presji środowiskowych.

W 2019 r. GBIF nagrodził 9 zwycięzców za ich rozwiązania w zakresie udostępniania i ulepszania istniejących narzędzi, danych i usług związanych z bioróżnorodnością. Pierwsza nagroda ( Wherenext ) optymalizuje proces porównywania, selekcji i uzupełniania brakujących danych (użytkownicy wybierają grupę taksonomiczną i interesujący region, następnie aplikacja generuje modele rekomendujące nowe obszary badawcze pod kątem spodziewanych różnic w zbiorowiskach gatunków występujących w różnych środowiskach i siedliska.

INPN i GBIF praca razem we Francji za pośrednictwem interfejsu wymiany danych (w obu kierunkach), a wikidane może być wezwany; Moduł EXPORT od GeoNature powinna ułatwić rozpowszechnianie danych OpenData poprzez krajowej platformy SINP mogą teraz łatwiej zintegrować donnése GBIF, aby skorzystać z SINP wspólnotowego (za pośrednictwem platform regionalnych). Przeprowadzane są okresowe aktualizacje danych z francuskiej platformy do GBIF, przy czym prawa do transmisji są ujęte w karcie INPN.

Zobacz również

Powiązane artykuły

Linki zewnętrzne

Bibliografia

  1. portal GBIF (październik 2013)
  2. ziemiaobserwacje.org
  3. [1] Badania sieci i komunikacji, NETCOM, tom. 27 (2013), nr 1-2 s. 154-164, PDF, 11p
  4. CRYER, Phil i in. (2009), Adoption of Persistent Identifiers for Biodiversity Informatics  : wydawca Sekretariatu GBIF
  5. http://community.gbif.org/pg/groups/1058/persistent-identifiers-interest-group/
  6. Julien Vinzent, start-up z Marsylii umieszcza bioróżnorodność w „otwartych danych” ; 2011-09-15
  7. Di Febbraro, M. et al., 2013. Wykorzystanie nisz klimatycznych w badaniach przesiewowych gatunków introdukowanych w celu oceny ryzyka rozprzestrzeniania się: przypadek z amerykańską wiewiórką szarą H. Verbruggen, ed. PLoS 1, 8 (7), s.e66559. Dostępne pod adresem : http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0066559
  8. gbif.org (2013) Polecane wykorzystanie danych Zmieniające się nisze i kontrola gatunków inwazyjnych
  9. Portal Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO) i prezentacja (w języku hiszpańskim)
  10. Mota-Vargas, C. i Rojas-Soto, OR, 2012. Znaczenie określenia geograficznego rozmieszczenia gatunków dla ochrony: przypadek brodatej kuropatwy. Journal for Nature Conservation , 20 (1), s. 10-17. http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1617138111000422 ).
  11. Mota-Vargas, C. et al., 2012. Analiza geograficzna i ekologiczna kuropatwy brodatej Dendrortyx barbatus : pewne informacje na temat stanu jej ochrony. Bird Conservation International, s. 1-15. ( http://www.journals.cambridge.org/abstract_S0959270912000329 )
  12. https://www.gbif.org/fr/news/2mixX9oDrJI2W3AqPFOXI3/wherenext-gagne-le-defi-gbif-ebbe-nielsen-2019  ; patrz też: https://www.gbif.org/fr/news/2mixX9oDrJI2W3AqPFoxI3/wherenext-gagne-le-defi-gbif-ebbe-nielsen-2019 lub w języku angielskim: https://www.gbif.org/news/ 2mixX9oDrJI2W3AqPFOXI3 / gdzie następny-wygrywa-2019-gbif-ebbe-nielsen-wyzwanie
  13. Do połączenia TaxHub z wikidata; https://github.com/PnX-SI/TaxHub/tree/master/data/scripts
  14. Inwentaryzacja dziedzictwa przyrodniczego „  INPN integruje dane z GBIF (globalny system informacji o różnorodności biologicznej)  ” , na stronie mnhn.fr ,22 października 2019 r.(dostęp 14 października 2020 r . ) .
  15. np.: 2018 https://inpn.mnhn.fr/actualites/lire/9061/